抗体滴定

爱白衣杀手

关于抗体滴定我想请问最后是计算信噪比判断吗？是用"阳性群标记信号的geomean/阴性群标记信号的geomean"吗？例如单标APC的滴定是用阳性群APC信号的geomean/阴性群APC信号的geomean"吗？

niwanmao

爱白衣杀手 发表于 2015-7-19 10:16
请问在flowjo上怎么计算这个数值呢？

首先在直方图上圈出阳性群和阴性群，然后添加statistics，读出阳性群和阴性群的geomean，并且读出阴性群的SD，最后按照前述公式计算。
如下图根据公式计算出SI为5.08

niwanmao

(阳性群标记信号的geomean-阴性群标记信号的geomean)/2*阴性群的SD

爱白衣杀手

niwanmao 发表于 2015-7-18 20:14
(阳性群标记信号的geomean-阴性群标记信号的geomean)/阴性群的SD

请问在flowjo上怎么计算这个数值呢？

爱白衣杀手

niwanmao 发表于 2015-7-18 17:12
首先在直方图上圈出阳性群和阴性群，然后添加statistics，读出阳性群和阴性群的geomean，并且读出阴性群 ...

倪老师您好，如果直方图上信号明显不呈正态分布还用geomean计算信噪比吗吗？还是用median?

niwanmao

爱白衣杀手 发表于 2015-8-15 15:39
倪老师您好，如果直方图上信号明显不呈正态分布还用geomean计算信噪比吗吗？还是用median? ...

明显不呈正态分布的，一般就说明可能是由于细胞死亡或非特异性染色过强造成的，正常情况下选择表达良好的细胞，并且保证细胞活力，用这种细胞来计算信噪比才是对的。

爱白衣杀手

niwanmao 发表于 2015-8-16 20:57
明显不呈正态分布的，一般就说明可能是由于细胞死亡或非特异性染色过强造成的，正常情况下选择表达良好的 ...

谢谢倪老师，我又遇到个问题，我标的抗原有阴性，低表达，高表达三种同时存在又如何滴定呢？怎么计算？三者能分开最好。

niwanmao

爱白衣杀手 发表于 2015-8-16 21:16
谢谢倪老师，我又遇到个问题，我标的抗原有阴性，低表达，高表达三种同时存在又如何滴定呢？怎么计算？三 ...

是这样的，如果要滴定抗体，就得找能够高表达该抗原的细胞进行滴定，滴定抗体，针对的是抗体，而不是细胞，所以细胞种类是可以换的。

wksnzh

niwanmao 发表于 2015-8-16 21:41
是这样的，如果要滴定抗体，就得找能够高表达该抗原的细胞进行滴定，滴定抗体，针对的是抗体，而不是细胞 ...

抗体滴定直接看图分群好不好不行么，为啥还要计算？

niwanmao

wksnzh 发表于 2017-4-12 19:59
抗体滴定直接看图分群好不好不行么，为啥还要计算？

计算出来比较客观。肉眼能看出显著差异当然也可以喽。