请求大家帮忙解答关于阳性率和MFI的问题，谢谢了

oymy

要检测细胞表面蛋白的表达情况，之前用阳性率看表达情况，发现是单峰，而且药物处理后，峰有位移，所以改用MFI。看到一篇文献中给出了这样的公式：The increase in mean fluorescence intensity (ΔMFI) was calculated as follows: (MFI with specific mAb – MFI with isotype control) / MFI with isotype control. The relative MFI (rMFI) value was calculated to compare the difference between the ΔMFI of a specific treatment and control as follows: ΔMFI of specific treatment / ΔMFI of control treatment × 100%.  我也想按这种方法进行一下分析。
请问，mean值是看P1门的，还是应该看P2门的呢？因为没有明显的阴阳两个峰，是不是应该看P1门的mean值呢？谢谢大家！

还有请问，图2的单参数直方图的拖尾可能是什么原因造成的呢？谢谢！

niwanmao

看P1门所有的。

阿依依啊

那岂不是P1门圈的细胞数越小MFI就会越大？有没有相对严谨一点的方法计算MFI？

niwanmao

阿依依啊 发表于 2018-7-16 16:40
那岂不是P1门圈的细胞数越小MFI就会越大？有没有相对严谨一点的方法计算MFI？ ...

不会，只要细胞数量达到足够的统计学要求，例如50个以上，分布均匀，就不会有太大差异。
这已经是很严谨的，为什么会觉得不严谨呢？

阿依依啊

我自己的结果圈大圈小之后MFI值就变化很大，可能也跟染色的细胞个数少有关。。

niwanmao

阿依依啊 发表于 2018-7-16 20:13
我自己的结果圈大圈小之后MFI值就变化很大，可能也跟染色的细胞个数少有关。。 ...

MFI其实在本质上不是受细胞数量影响，而是受细胞分布影响。因为你圈的门小了，可能刚好把某些荧光强度的细胞排除掉了，就造成MFI变化很大。
但是可以肯定的是，门内细胞越多越好，在2000以上一般不会有什么大变化。