FSC的阈值设置

yangjf

大家好，我使用CytoFLEX做流式的时候，圈门发现有两团细胞群，而我做的是培养细胞，理论应该只有一团细胞，那另一团是不是细胞碎片呀，设置FSC的阈值最小为多少，可以排除细胞碎片呢？

我想成大牛

SSC/FSC最好用线性的坐标，排除是否是碎片只要加一个活死染料就可以了。阈值也是要根据情况来设置的，并不是一成不变的。

niwanmao

大的那群概率大一些。FSC和SSC建议用线性。

yangjf

niwanmao 发表于 2019-7-1 20:37
大的那群概率大一些。FSC和SSC建议用线性。

你好，这是我把SSC/FSC坐标换成线性，然后改小了坐标范围得到的散点图，从这个图上看，圈门就还遵守平时的规则，这线性和对数坐标咋这么大区别呢，老师？

yangjf

我想成大牛 发表于 2019-7-1 17:30
SSC/FSC最好用线性的坐标，排除是否是碎片只要加一个活死染料就可以了。阈值也是要根据情况来设置的，并不 ...

我是看到说阈值获取events时保留FSC的最小值，获取细胞时可以去掉特别小的细胞碎片等噪音信号。这个操作理论上看起来就很方便，所以还比较关注。能问一下有具体的调节阈值的案例吗？

niwanmao

yangjf 发表于 2019-7-3 09:11
你好，这是我把SSC/FSC坐标换成线性，然后改小了坐标范围得到的散点图，从这个图上看，圈门就还遵守平时 ...

线性是按照1、2、3、4这样的坐标绘制的。
而对数坐标是按照0、10、100、1000这样绘制的。
展示出来当然不同喽。