散点图杂点太多怎么办？如何单个样本手动调补偿?

咩咩咩

1. 染了488和PI，分群之后四周的杂点好多，请问这个怎么解决啊？调了cell和singlets但是无法完全弄干净

cells

singlets

十字门

2. 用488和PI单染管调了自动补偿，应用之后发现有些样本的群体还是斜的，比如下图，请问如何给单个样本调补偿啊？上机的时候好像没有调补偿，而且补偿一应用就是所有样本，最奇怪的是我调了补偿，应用后这个十字图完全没变化……感恩各位老师解答~

自动补偿

自动补偿后

niwanmao

你测的是哪两个指标？这些杂点应该是电子噪音和非特异信号，只要不明显影响比例，问题不大。

咩咩咩

niwanmao 发表于 2022-4-20 19:37
你测的是哪两个指标？这些杂点应该是电子噪音和非特异信号，只要不明显影响比例，问题不大。
...

PI和M期的一个磷酸化的蛋白

咩咩咩

还有一个问题是，有一个样本我看不到具体质量信息，是一个488单染管，这个是上机时候的问题吗？因为上机是有老师帮忙操作的。

niwanmao

咩咩咩 发表于 2022-4-21 09:22
还有一个问题是，有一个样本我看不到具体质量信息，是一个488单染管，这个是上机时候的问题吗？因为上机是 ...

如果每个样本都有，包括其它人的样本也有，那么需考虑电子噪音。
如果只有你的样本或者只有几个样本有，得考虑样本处理问题。
如果跑蒸馏水也有，则需考虑仪器液路脏。