数据分析--如何判定流式数据的科学系的标准

向前

我要对流式数据分级，只根据抗体结合百分率分级，合理吗？

我以抗体结合百分率制定了评判标准：

   99%-100%表示为 A+++;
     90%-99% 表示为 A++;
     80%-90% 表示为 A+;
     70%-80% 表示为 A;
     60%-70% 表示为 B+;
     50%-60% 表示为 B;
     30%-50% 表示为C ;
     1%-30% 表示为 D;
     0-1%表示为E
制定评级的标准还有其他的参数吗？
附件是我收集到的五种流式数据，请帮忙解析一下，谢谢了。{:soso_e100:}

bs-3511R-FITC-U937-20141226.pdf (60.06 KB, 下载次数: 5)

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bs-2979R-(FITC)-A549-20150119.pdf (60.74 KB, 下载次数: 0)

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niwanmao

1、你为什么制定此种标准？目前两种趋势，一种就是免疫分型中采用的表达强度（high/med/low/neg），一种就是定量检测时的百分比或MFI。两者不能相互替代，你这种标准相当于把表达强度和百分比混为一谈，这是错误的。

2、你上传的6个文件是想让大家帮你解读什么？

向前

niwanmao 发表于 2015-2-4 20:36
1、你为什么制定此种标准？目前两种趋势，一种就是免疫分型中采用的表达强度（high/med/low/neg），一种就 ...

谢谢倪老师的关注。
目前我检测的数据表达有这几种现象：
                                                   细胞团全部向阳性区域移动，只是移动的程度不同。
                                                   细胞团一部分在阴性区，一部分在阳性区。
如何解释这两种现象呢。哪一种现象更具有科学性呢？
                                                  
  

kobe327292007

向前 发表于 2015-02-05 09:01:57

                               
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谢谢倪老师的关注。
目前我检测的数据表达有这几种现象：
                                            

这个做明白了，很可能得到新的细胞亚群。比如，NK细胞根据CD56表达丰度就分为CD56bright和dim两个亚群。当然还需要更多的验证来确定新的亚群。

niwanmao

向前 发表于 2015-2-5 09:01
谢谢倪老师的关注。
目前我检测的数据表达有这几种现象：
                                             ...

细胞群全部向阳性区移动，如果能排除掉非特异性染色，那么就应该解释成这些细胞都有表达该种抗原，但是表达密度低（即弱表达），移动程度的多少，就代表其表达量的多少。

而细胞群分为阳性和阴性两群，说明部分细胞出现了表达，而另一部分细胞没有表达。

这两种情况本来就都是很合理的存在，你可能想多了，呵呵。

向前

niwanmao 发表于 2015-2-4 20:36
1、你为什么制定此种标准？目前两种趋势，一种就是免疫分型中采用的表达强度（high/med/low/neg），一种就 ...

倪老师，免疫分型中采用的表达强度中的high/med/low/neg档次是如何划分的呢？
表达强度和百分比不是抗体结合百分比，那么表达强度是指的是什么？抗原表达量吗？

niwanmao

向前 发表于 2015-2-6 15:00
倪老师，免疫分型中采用的表达强度中的high/med/low/neg档次是如何划分的呢？
表达强度和百分比不是抗体 ...

免疫分型中各档强度是根据该抗原的最高表达强度来平均划分的。如果最高强度在10E4以上，而阴性区域在10E2以内，那么10E2~10E3为low，10E3~10E4为med，10E4~105为high。

表达强度和百分比不能等同，如下图，我画了个示意图，蓝色和红色都是大约50％的表达百分比，但是表达强度不同，蓝色的强度只能算dim，即介于阳性和阴性之间的强度，而红色曲线的阳性峰已经算接近med或high了。

向前

niwanmao 发表于 2015-2-6 15:08
免疫分型中各档强度是根据该抗原的最高表达强度来平均划分的。如果最高强度在10E4以上，而阴性区域在10E2 ...

为什么图1不能用作FCM实验，图2中的抗体就可以用作FCM实验呢。我问帮我检测抗体的商家，他说是看的两个峰的分离距离， 重叠1/3以下都可以用来做流式，重叠1/3以上就不可以做流式了。他们的技术支持现在不在，您能帮我分析一下的重叠怎么看的吗？

niwanmao

向前 发表于 2015-2-6 15:21
为什么图1不能用作FCM实验，图2中的抗体就可以用作FCM实验呢。我问帮我检测抗体的商家，他说是看的两个峰 ...

前面两个抗体不能做流式的话，那么这两个图是什么仪器做出来的？

niwanmao

向前 发表于 2015-2-6 15:21
为什么图1不能用作FCM实验，图2中的抗体就可以用作FCM实验呢。我问帮我检测抗体的商家，他说是看的两个峰 ...

糖皮质激素受体这个批号是可以的：http://biossusa.com/store/bs-0252r.html

第二个VEGFR2你这个批号在官方网站上查不到，估计批号过期了，但官方网站有大量可以用于FCM流式的VEGFR2抗体：http://biossusa.com/store/catalo ... er=sku&q=vegfr2