翻译：MIFlowCyt-流式细胞术实验最低信息标准

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流式中文网注：MIFlowCyt全称是Minimum Information of Flow cytometry，可以译做最低标准，也可以译做基本信息，是现在向流式专业杂志投稿所必须提供的信息，所以了解这方面的内容是必需的。遗憾的是这方面信息填写太复杂，所以如果想投国外流式专业杂志的FLOWER，可以考虑借助http://flowrepository.org/来辅助。

      之前投稿过Cytometry Part A, 其对流式数据的要求很多，花了我好长时间整理数据。虽然投稿最终被拒，但是，读到的这篇文献中提到的关于“流式细胞术实验最低信息标准”的内容还是很有意义的，主要讲含有流式数据文章的规范，发上来共享。主要翻译了正文（欢迎指正{:soso_e113:}），三个补充材料还没有翻译，如果大家认为有必要的话，过段时间再翻译放上来。

原文： MIFlowCyt The Minimum Information About a Flow.pdf (106.77 KB, 下载次数: 135)

2015-2-5 20:05 上传

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原文章

部分译文：摘要： 科学研究的一个基本要求是，已发表的结果能够经得起独立的验证和反驳。最低数据标准可以提供一个能够明确说明实验发现的规范，从而帮助数据提供者，使用者和出版商。因此，我们提出了流式细胞术实验的最低数据信息(MIFlowCyt)标准，陈述了报道流式细胞术（ FCM）实验所要求的最少信息。我们组织了由生物信息学家，计算统计学家，软件开发者，仪器制造商和临床与基础研究科学家组成的一个跨学科团队来制定这样一个标准。随后，这一标准经由国际细胞术发展协会（ ISAC） 数据标准工作组， 标准委员会，会员和理事会审定。 MIFlowCyt标准包括描述 FCM 实验所涉及样本和试剂的建议，进行分析所用仪器的配置和用以解读原始输出数据的数据处理方法。 ISAC 代表了由科学家，软件和硬件生产商构成的 FCM 科学共同体将 MIFlowCyt 采纳为一种标准。科学界和出版界采纳 MIFlowCyt 将有助于第三方理解和再使用 FCM 数据。


关键词： 免疫学；荧光激活细胞分选；知识表示

流式细胞术（ FCM）系统被研究者应用已超过 30 年，并且这一领域仍在继续高速发展。通过高通量的方式表征单细胞的表型和功能， FCM 推动了基础和临床研究的重大发展。现在这一技术的发展实现了每天数千样本自动化、多参数的分析（ 1）。每个数据集对百万个单细胞进行多维度的记录，所产生的数据大小和复杂性与基因表达微阵列相似。和微阵列领域一样，  FCM 数据的收集能力超过了用于数据处理和分析的计算方法。而且，报道由于缺乏标准化，限制了在已有FCM 数据方面的协作，独立的验证、反驳和荟萃分析，导致因解释欠妥造成的数据财富价值降至最低（ 2）。在缺乏报道标准的情况下，这样的技术进步也给如今的生物医学和免疫学文献的生产者，评审人和消费者带来了相当大的挑战（ 3）。
为了解决这些问题，我们组织了由生物信息学家，计算统计学家，软件开发者，仪器制造商和临床与基础研究科学家组成的一个跨学科团队，来制定 FCM
的最低信息报道标准。这一庞大的协作团队提出了流式细胞术实验的最低数据信息（ MIFlowCyt）的初始版本。这一提议经过了国际细胞术发展协会（ ISAC）数据标准工作组（ DSTF）的多次审议，正是这一工作组承担了过去 30 年所有 FCM相关标准的制定，如 FCS 数据文件标准（ 4）。 MIFlowCyt 又经过了更广泛的科学共同体的审定，最终由 ISAC DSTF， ISAC 数据标准委员会批准，并于最近被ISAC 理事会采纳为 ISAC 标准。 MIFlowCyt 也得到了美国国家过敏症与传染病研究所（ NIAID） 下属的过敏、 免疫和移植部门的数据互操作指导委员会的支持，他们大力支持使用 MIFlowCyt 和相关的数据格式标准。


翻译后的MIFlowCyt（在线阅读）：
https://flowcyto.cn/bbs/forum.php?mod=attachment&aid=NzYyMXxkOGZlZjdkYXwxNzMyMjU1OTg1fDB8



未翻译的材料：
未翻译补充材料一-实验注释范例.pdf (396 KB, 下载次数: 70)

2015-2-5 20:07 上传

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补充材料1

未翻译补充材料三-MIFlowCyt所需信息的概括.pdf (18.68 KB, 下载次数: 49)

2015-2-5 20:07 上传

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补充材料3

未翻译补充材料二-具体的MIFlowCyt的条款说明和范例.pdf (75.84 KB, 下载次数: 49)

2015-2-5 20:07 上传

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补充材料2

niwanmao

MIFlowCyt全称是Minimum Information of Flow cytometry，可以译做最低标准，也可以译做基本信息，是现在向流式专业杂志投稿所必须提供的信息，所以了解这方面的内容是必需的。遗憾的是这方面信息填写太复杂，所以如果想投国外流式专业杂志的FLOWER，可以考虑借助http://flowrepository.org/来辅助。

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好吧，发完才发现有人问过类似的问题{:soso_e153:}

niwanmao

不好意思，发现您已经加入了翻译活动，所以按照每100个汉字2颗流星计算，一共3600个汉字，应该算72颗流星，故在2楼中补加62颗流星。

感谢您参加流式中文网大家庭的建设：）

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niwanmao 发表于 2015-2-6 11:40
MIFlowCyt全称是Minimum Information of Flow cytometry，可以译做最低标准，也可以译做基本信息，是现在向 ...

之前投稿Cytometry Part A时，其实我是参考杂志中已投稿文章，参考多个他们的MIFlowCyt checklist附件，最后写我自己的checklist。过了关，进入审稿，最终由于内容问题被拒

facetodog

{:soso_e163:}{:soso_e163:}{:soso_e163:}

Arcrain

好东西！楼主真用心！