逐级设门和逻辑设门，你更喜欢哪种？

niwanmao

流式细胞仪可以收集您感兴趣的事件，并且会把“看到”的每个事件都记录下来，包括碎片、缓冲液里面的杂质。 作为细胞学家，我们需要排除掉那些不需要的信号，保留我们需要的细胞信号，并选出我们感兴趣的细胞亚群。

设门方式主要有两种：逐级设门和逻辑设门。

当从样品中选择感兴趣的细胞时，可以选择逐级设门或逻辑设门，这取决于你使用的细胞仪和你要解决的问题。 老牌BD FACSCalibur上的Cell Quest和Cell Quest Pro软件擅长利用逻辑门，而BD Fortessa则使用逐级设门。

这两种设门方式之间有什么区别呢？

逐级设门
这是流式细胞仪和获取软件最常用的默认设门方式。这种设门方式是采用父级门和子级门，逐级向下设们，直到最后选出感兴趣的细胞。父门可以包含一个或多个子级门。

逻辑设门
逻辑这个词来自于19世纪数学家George Boole及其研究的逻辑几何学系统。逻辑设门允许门与门之间以AND、OR、NOT进行逻辑组合，对于选出同时表达抗原a、b、c的细胞特别有用。

逻辑设门在多色分选时很有用，例如用NOT门轻松排除掉不希望分选的细胞。在多色流式分析稀有细胞时，逻辑门配合逐级门也十分有用。

但是实际应用过程中，我们可以将逐级设门和逻辑设门组合起来用，以下图为例：

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小红子

请教一下，如果是逻辑设门，是不是每个样品的阈值和增益都必须一样

niwanmao

小红子 发表于 2017-7-20 10:28
请教一下，如果是逻辑设门，是不是每个样品的阈值和增益都必须一样

为什么有这个说法？？不过一般获取的时候，基本上都不会乱动这些条件的，即使微调了，对逻辑设门也不会有影响啊，只要你按照你预设的逻辑进行设门即可。