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测序时代,流式细胞术有哪些改变?

发布者: niwanmao | 发布时间: 2017-11-9 19:10| 查看数: 1353| 评论数: 0|帖子模式

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这是GEN网站提出的一个问题,采访了BD、Millipore、Thermo Fisher、Bio-Rad等公司4位来自应用和市场方面的专家,流式中文网将文章内容编译如下,隐去部分涉及宣传的内容,以便大家能够从更专业的角度去理解对话内容。

问:为了跟上新一代测序技术的步伐,流式细胞术的方法发生了哪些改变?过去数年,在新药领域流式细胞术有了哪些新用途?


Dr. Balderas:
Fig1.jpg
Robert Balderas, Ph.D., Vice President, Market Development, BD Biosciences

流式细胞术越来越多地与其他技术结合,为理解细胞构成和功能提供更丰富的数据,特别是与下一代测序应用(如RNA测序,RNA-seq)结合使用。细胞分选技术的整合使得对RNA-seq应用中更容易对单细胞的细胞受体表型进行细致深入的研究。

流式细胞术在药物开发和发现领域中有不少应用,包括但不限于:
(1)利用高复杂度的流式细胞术(30个参数)对宝贵血液样品中的深度分析;
(2)磷酸化测定以揭示和记录特定细胞群体中的关键信号传导途径;
(3)细胞周期和DNA损伤和修复机制;
(4)测量各种体液中可溶性蛋白的微球技术。
如今的细胞仪很容易整合到高通量的机器人系统中,使科学家能够使用先进的流式细胞仪barcoding技术来提高药物研发的速度。



Mr. Wirth:
Fig2.jpg
Jean-Charles Wirth, Head of Applied Solutions, MilliporeSigma

在过去的十年里,测序技术从一种只在中心实验室进行的专门技术转变为能够在自己实验室里完成的个人研究型技术,变得更容易、更便宜、速度也更快。

流式细胞术领域也取得了相似的进展,流式细胞术能进行细胞或颗粒的高通量和定量分析,已成为药物发现的理想技术。在过去的三至四年中,人们越来越意识到胞外囊泡(extracellular vesicle,EV)如外泌体对细胞通讯非常重要。EV领域的文章数量呈指数增长,并且发现了指示疾病的生物标志物。一些新式的流式细胞仪也将CCD检测系统升级使其具有非常高的灵敏度,以便用于检测和鉴定这些小颗粒。已有不少文章报道了心血管疾病、肝脏疾病、神经胶质瘤、膀胱癌和先兆子痫等疾病的潜在生物标志物。在寻找新的候选药物时,这些生物标志物可以为将来的发现提供所需的有效治疗指征。



Ms. Bradford:

Fig3.jpg
Jolene A. Bradford, Associate Director, Flow Cytometry Systems, Thermo Fisher Scientific

基因测序大部分是基于总体平均的,虽然信息丰富,但这种分析是基于假定平均值反映了主要的生物机制的,因此掩盖了稀有细胞亚群,并忽略了整个人群中细胞与细胞的差异。为了充分了解细胞异质性对生物功能的贡献,必须采用单细胞方法。流式细胞术是对异质细胞群体进行单细胞研究的极佳方法。

在药物开发领域,研究人员正在寻找如何使流式细胞术以更高通量采集样品的方法,现在有了自动化的板式采集选择,并结合机器人技术,使得高效自动化成为可能。

许多药物开发研究人员希望同时监测多种细胞健康参数,例如细胞活力、细胞凋亡、增殖等,流式细胞仪可以使用最少的样品实现高通量检测。



Ms. Ovadia:
Nicole Ovadia, Senior Product Manager, Bio-Rad
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流式细胞仪可以与下一代测序(NGS)相结合,不仅可以观察细胞表型,还可以将来自同一细胞的基因组信息与表型数据配对。这正在改变免疫肿瘤学研究的现状。

免疫疗法(如抗PD1和CAR-T细胞)在治疗癌症和提高难治性疾病患者的存活率方面极具前景。但开发更好的药物和改善治疗成功率更具挑战性的方面是需要发现和分析非常罕见的肿瘤细胞群。流式细胞术是这种应用的理想选择,由于其快速检测能力(每秒数千到数万个事件数),因此能够在短时间内检测到许多罕见事件,结合多参数检测能力(高达30~50个甚至更多参数),研究人员可以很容易找到稀有细胞,并查看单细胞的各种特征,有助于提高研究人员发现能够更好地预测治疗结果或发现疾病进展的生物标志物。



信源:
https://www.genengnews.com/gen-a ... flow-cytometry/6196

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