细胞功能和分化全部由调节基因表达的细胞内转录因子控制。 由于这些因子通常是蛋白质，因此可以使用针对蛋白质某些特定表位的抗体来检测它们。 这样，转录因子的检测本质上与检测细胞表面的蛋白质没有区别。 然而，由于感兴趣的蛋白质位于细胞内，可能在细胞质中、亚细胞结构内或是细胞核中，因此固定和破胞膜、核膜、质膜是必须的。现在不少研究生还是习惯用Western Blot去检测此类蛋白表达，实际上，流式可以检测不少转录因子，既节省了时间，又可以获取更为客观的定量结果。

下表中列出了流式细胞术可检测的常见转录因子，供大家参考：



参考文献：
Cossarizza A, Chang HD, Radbruch A, et al. Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies. Eur J Immunol. 2017 Oct;47(10):1584-1797.