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[细胞周期] 细胞周期拟合模型选择

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发表于 2018-12-23 23:23:07 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
对于细胞周期分析,到底是用watson模型还是J-C模型()呢?
另外对于细胞周期而言,我们要尽量保证CV值小,这里的CV值是指一组中各个细胞之间的差异还是什么?我一直不太清除这里的CV具体值谁的CV?
请老师指点一下。

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Watson模型应该是默认的,最常用的。 CV一般用G1期的CV
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发表于 2018-12-23 23:23:08 | 显示全部楼层
Watson模型应该是默认的,最常用的。
CV一般用G1期的CV
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 楼主| 发表于 2019-3-20 23:20:14 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2018-12-23 23:23
Watson模型应该是默认的,最常用的。
CV一般用G1期的CV

想接着这个问老师,我用的是Watson模型,但是我怎么去判断我周期G1 S G2期结果的准确性呢,我稍微动一下拟合各峰的位置,拟合的结果差异很大,所以我想请问老师
怎样去判断拟合的数据是否准确,看哪些指标呢,或者是否需要手动调节,怎么调节呢?

谢谢,有点着急
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发表于 2019-3-22 08:51:35 | 显示全部楼层
Veblen 发表于 2019-3-20 23:20
想接着这个问老师,我用的是Watson模型,但是我怎么去判断我周期G1 S G2期结果的准确性呢,我稍微动一下 ...

我个人的经验:
1、看CV值和RCS值。尽量小。
2、看最终的拟合曲线和真实峰的重叠程度。
这两种方法得到的结果可能不一定一致,更倾向以第2条标准为主,同时CV和RCS尽量小(不一定最小)。
如果你说的稍微动一下就相差很大,那么肯定是你的设置上出了什么问题。
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