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艾森 NovoExpress 流式软件使用简介

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发表于 2014-3-9 21:51:45 | 显示全部楼层 |阅读模式

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一、ACEA NovoExpress简介
ACEA NovoExpress是一款功能强大,操作简便的流式分析软件,它同时也是ACEA NovoCyte系列流式细胞仪和自动上样器的配套软件,提供了中文和英文的多语言操作环境,并可在两种语言环境中相互进行快速切换。NovoExpress除了可用于控制仪器进行样本采集控制,仪器QC,仪器维护等,还可以用于分析流式实验数据,并生成报告。

软件操作界面十分简洁明了,默认条件下由标题栏、菜单栏、工具栏、仪器设置面板、仪器控制面板、工作区、实验管理面板、状态栏组成,如下图所示。在“视图”菜单可设置需要显示的面板。比如“仪器状态”面板,该面板默认为隐藏,在菜单中选中显示该面板后,“仪器状态”面板将显示所连接仪器的液体状态、PMT电压和激光器功率。用户可根据个人偏好设置各个面板的显示及位置。

1软件主界面.gif


仪器的QC测试和排气泡、清洗、冲洗、强化冲洗、灌注、清除堵塞、反冲等液路维护可分别通过菜单栏的“仪器”菜单的子菜单项完成。

样本采集之前只需在仪器设置面板设置采集的参数,停止条件,样本流速以及阀值等采集条件后,即可进行后续的样本采集及数据分析工作。

设置好样本的采集条件之后,只需通过仪器控制面板就可非常方便地控制仪器进行样本采集。仪器控制面板包含“当前样本信息”和“实验控制”两部分内容。“当前样本信息”区域中显示了当前样本的事件数、平均每秒钟采集的事件数、采集时流过的样本体积以及采集时间。在采集过程中,这些信息会实时刷新。“实验控制”中包含“下个样本”和“采集”按钮。点击“下个样本”可切换当前样本或创建空白样本。点击“采集”按钮可对当前样本采集数据,若当前样本包含事件数据,可选择增加事件或重写事件。采集过程中,“采集”按钮变为“停止”,点击可停止当前样本的采集。若配置了自动上样器,“实验控制”中则显示为“下个样本”、“混匀”、“单孔采集”、“自动采集”。“单孔采集”采集单个样本,“自动采集”可采集多个样本。
在工作区可以随时通过工具栏按钮创建散点图、密度图、等高图、柱状图显示样本的事件,并在图上创建矩形门、椭圆门、象限门、多边形门、区域门、双区域门等进行分析。还可以创建细胞周期图进行细胞周期分析。若希望删除样本的部分事件,可以通过“样本”菜单的“删除事件”实现。

NovoExpress采用了数字化全补偿矩阵进行荧光补偿,为了方便用户的使用,提供了矩阵补偿、快速补偿、自动补偿三种设置荧光补偿的方式。

NovoExpress的实验数据保存在 *.ncf 的实验文件中,每个实验文件可以保存多个样本的数据。软件使用组、标本、样本的树形结构来组织管理实验数据。用户可以在实验管理面板通过右键菜单、工具栏、快捷键等方式创建组、标本和样本,也可以点击开始菜单或实验管理面板工具栏的“工作列表”按钮,在打开的“工作列表”中批量创建标本和样本。

软件包含了强大的模板功能,模板中可以包含组、标本和样本的设置。用户可通过在“实验管理”面板右键复制与粘贴、拖放、使用工具条按钮、导出与导入等方式应用模板,大大减少用户常规工作的工作量。

用户既可以导入别的流式分析FCS 2.0和3.0格式的数据文件进行分析,同时也可以将样本数据导出为FCS 3.0或CSV格式的文件,用于第三方流式分析软件的分析。

NovoExpress包含完整的报告功能。按照报告的生成方式,可将报告分为自动模式和非自动模式。用户可通过软件的打印功能打印单个或批量打印报告,也可以选择将报告生成PDF文件。

在“开始”菜单或实验管理面板可以创建统计表格,统计表格可以汇总任意多个样本、多个门、多个参数在同一表格中,方便批量分析数据,并对多个样本的实验结果进行对比。

由于ACEA NovoCyte具有无绝对计数管进行细胞的绝对计数功能,如果需要计算群的细胞数目,只需在“样本”菜单的“绝对计数设置”中设置样本的稀释比例、绝对数目单位后即可在表的统计信息或统计表格中查看自动计算的细胞数目。

二、NovoExpress应用举例

ACEA NovoExpress具有用户界面友好直观、数据分析功能强大、报告输出自动完成、荧光补偿灵活方便等特点。

以辅助HIV诊断的淋巴细胞亚群分析为例,首先将人外周血样本用CD3 FITC/CD8 PE/CD45 PerCP/CD4 APC四色抗体孵育,然后加入红细胞裂解液液裂解红细胞。样本制备好后,上流式细胞仪检测。

在ACEA NovoExpress中的“仪器设置”面板进行简单的采集条件设置,在“仪器控制”面板采集样本,并可实时查看样本采集状态。在样本采集中或采集完成后,在“工作区”画图设门分析数据,设置荧光补偿。数据分析完成后,打印软件自动生成的报告。这样一个样本采集分析就完成了。这个过程在软件的各个模块以流程化的方式实现,简单清晰,即学即用。

其中,“仪器设置”和“数据分析”可以通过导入设置好的模板或上次样本分析的模板快速完成。一个文件中多个样本之间的模板复制可以通过拖拽的方式快速实现。

下图是ACEA NovoExpress做的CD3 FITC/CD8 PE/CD45 PerCP/CD4 APC四色淋巴细胞亚群分析的图。软件可以绘制各类图形,并可以颜色区分各细胞群。以双指数坐标的方式,可以将荧光补偿后荧光强度为负数的细胞显示出来。
2淋巴亚群.png

设置荧光补偿可以通过将自动补偿获得的补偿矩阵应用到样本,也可以通过拖动快速补偿滚动条设置。一次荧光补偿设置好之后,就可以通过将补偿模板应用到其他样本的方式实现荧光补偿。

下图为通过拖动快速补偿滚动条,快速准确地设置CD3 FITC和CD8 PE之间的补偿。
3补偿.jpg
数据分析完成后,使用NovoExpress直接打印或导出报告。该报告自动生成,也可以灵活地编辑,加入医院名称等个性化的内容。下图是一例淋巴细胞亚群分析的报告。

4报告.png

采集完成的所有样本以树形结构显示在“实验管理”面板。在树形结构中,一个病例下面可以有多个样本。病例还可以通过组的方式进行归类整理。模板的操作可以基于样本、病例或组。该树形结构极大地方便了对各种类型实验的管理。
作为ACEA NovoCyte流式细胞仪的配套软件,NovoExpress集仪器维护、样本采集、数据分析、报告打印于一体,功能强大,操作便捷,是一款值得推荐的优秀软件。

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发表于 2014-3-9 22:37:12 | 显示全部楼层
其实我觉得如果软件很好的话,是否可以精简部分免费开放给大家使用,打响产品的知名度?不然硬件很难和其他公司竞争的
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发表于 2014-3-25 12:47:04 | 显示全部楼层
这个软件木有下载的啊?
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发表于 2014-4-7 22:59:18 | 显示全部楼层
robocop: 这个软件木有下载的啊?


这个估计暂时没有,应该是随机的附带软件,可能是需要密码狗驱动的
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发表于 2014-4-8 07:50:46 来自手机 | 显示全部楼层

已经反馈给他们,他们还需要讨论。估计有点难。
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发表于 2014-4-16 22:09:43 | 显示全部楼层
我是下载适用报名的哈哈
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发表于 2014-4-16 22:29:04 | 显示全部楼层
葡萄粒 发表于 2014-4-16 22:09
我是下载适用报名的哈哈

据了解,他们公司还在讨论,要开放免费下载估计还是有点难度。
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发表于 2016-1-13 22:16:37 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2014-4-16 22:29
据了解,他们公司还在讨论,要开放免费下载估计还是有点难度。

试用了一下,软件的确不错。
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发表于 2018-7-28 08:42:07 | 显示全部楼层
视频呢,请站长再上传一遍
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发表于 2018-7-29 13:07:01 | 显示全部楼层
飞哥哥爱你呦 发表于 2018-7-28 08:42
视频呢,请站长再上传一遍

视频已失效,删除了。
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