一表看懂：人和小鼠B细胞6个亚群的表型、转录因子

niwanmao

昨天，看到一位站友在微信后台留言希望能够知道小鼠的B细胞Marker。


虽然这些内容之前也发过，但恰好最近在国外网站看到一张比较好的表格，于是编译分享给大家。相关缩写见表后。



缩写含义：
TFs, transcription factors（转录因子）;
Pax5, paired box gene 5（配对盒基因5）;
EBF, early B cell factor 1（早期B细胞因子1）;
OCT2, octamer transcription factor 2（八聚体转录因子2）;
BCL6, B cell lymphoma 6 protein（B细胞淋巴瘤6蛋白）;
IRF4, interferon regulatory factor 4（干扰素调节因子4）;
XBP1, X-box binding protein 1（X盒结合蛋白1）;
TACI, transmembrane activator and cyclophilin ligand interactor（跨膜活化因子和亲环蛋白配体相互作用因子）;
BCMA, B cell maturation antigen（B细胞成熟抗原，这是最近比较热门的骨髓瘤CART靶标）;
BR3, B lymphocyte stimulator receptor 3（B淋巴细胞刺激受体3）;
Ig, immunoglobulin（免疫球蛋白）。


另外还有一位热心站友希望能够发点SPICE方面的教程，放心，只要你们点的内容有意义，我都会翻你们的牌的。


参考文献：
Naradikian et al. 2014 and Melchers 2015.

chevalierx

倪老师你好，我在检测肺实质中的B细胞时发现过一群CD19+B220-CD138+细胞，并且这群细胞在感染后会消失，想请教下倪老师这群细胞是属于哪个B细胞阶段呢？

niwanmao

chevalierx 发表于 2017-12-4 20:59
倪老师你好，我在检测肺实质中的B细胞时发现过一群CD19+B220-CD138+细胞，并且这群细胞在感染后会消失，想 ...

应该是浆细胞

chevalierx

niwanmao 发表于 2017-12-4 21:49
应该是浆细胞

在做时间梯度的时候，发现B220-138+细胞下降的同时，B220+细胞增多了，一直不太能理解当中的变化，倪老师能给点提示么？谢谢

niwanmao

chevalierx 发表于 2017-12-4 21:59
在做时间梯度的时候，发现B220-138+细胞下降的同时，B220+细胞增多了，一直不太能理解当中的变化，倪老师 ...

其它标记有没有做？
另外单纯比例的变化说明不了问题，可能是浆细胞减少了，也可能是B细胞增多了，需要结合一下你们的课题内容。

chevalierx

niwanmao 发表于 2017-12-5 10:25
其它标记有没有做？
另外单纯比例的变化说明不了问题，可能是浆细胞减少了，也可能是B细胞增多了，需要结 ...

圈了个总的CD19，其他的标记没做。在肺部LPS刺激后，CD19+基本等于CD19+B220-CD138+和CD19+B220+俩群的总和。0时刻点有2群细胞，刺激2d后，CD138+细胞的比例随着时间增加比例逐渐降低直至消失，就剩下CD19+B220+细胞了。