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[凋亡检测] 凋亡圈门问题???

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发表于 2017-10-19 21:34:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
本帖最后由 Helen_ztt 于 2017-10-19 21:34 编辑

@niwanmao呼叫倪老师,请教倪老师凋亡圈门问题,因为是流式初学者,很多问题还没弄明白,问题粗浅,请多见谅啊!
第一组是空细胞,没做任何处理,我想拿来做阴性对照,如图negative control,分成三小团,最左边的是碎片吧,最右边的P2是主细胞团,中间的小团P1是什么呢?
当我加了染料开始,中间小团P1就增多,比如单染7AAD的时候,如图7AAD。
在7AAD组圈细胞时,当我只圈P2(如图7AAD-1),Q1里只有1.65%的细胞(这个区域应该是7AAD染色的细胞吧)。
但当我把P2和P1都圈上时(如图7AAD-2),Q1里可见25.2%的细胞,但是这些细胞有分成了两个小群,这是为什么?
问题1:我应不应该把P1圈进去?
问题2:如果把P1圈进去,为什么Q1细胞分成两个小群?是什么原因引起的?

谢谢!

negative control

negative control

7AAD

7AAD

7AAD-1

7AAD-1

7AAD-2

7AAD-2

最佳答案

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圈门的时候需要把两群都圈进去,因为细胞死了之后,fsc/ssc图上的位置就是有区别的。当然,阴性对照上,死细胞位置上最好不要有多少细胞或者少量细胞。收细胞时,如果是贴壁细胞,同样要把漂着的细胞收集,以前师姐告诉我说,这部分细胞也可能是药物导致细胞的死亡的。
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发表于 2017-10-19 21:34:40 | 显示全部楼层
Helen_ztt 发表于 2017-10-20 10:00
是的,是C6,你好厉害,怎么看出来的?

圈门的时候需要把两群都圈进去,因为细胞死了之后,fsc/ssc图上的位置就是有区别的。当然,阴性对照上,死细胞位置上最好不要有多少细胞或者少量细胞。收细胞时,如果是贴壁细胞,同样要把漂着的细胞收集,以前师姐告诉我说,这部分细胞也可能是药物导致细胞的死亡的。
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发表于 2017-10-20 07:50:16 | 显示全部楼层
你把SSC用LIN显示出来看看,有可能是已发生凋亡的细胞,可以试着圈进去看看。
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发表于 2017-10-20 09:19:42 | 显示全部楼层
有预感这是C6仪器得到的数据
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 楼主| 发表于 2017-10-20 09:58:44 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2017-10-20 07:50
你把SSC用LIN显示出来看看,有可能是已发生凋亡的细胞,可以试着圈进去看看。 ...

这张是LIN的SSC的,碎片上方有一小团,我需要把它圈进去吗?

7AAD--FSC/SSC

7AAD--FSC/SSC
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 楼主| 发表于 2017-10-20 10:00:58 | 显示全部楼层
ghqiu09 发表于 2017-10-20 09:19
有预感这是C6仪器得到的数据

是的,是C6,你好厉害,怎么看出来的?
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2017-10-20 10:57:55 | 显示全部楼层
Helen_ztt 发表于 2017-10-20 10:00
是的,是C6,你好厉害,怎么看出来的?

一般只有C6的坐标才能到10的7次方
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发表于 2017-10-20 14:49:14 | 显示全部楼层
家的感觉 发表于 2017-10-20 10:57
一般只有C6的坐标才能到10的7次方

我倒是先看到的是楼主7AAD-2图上,三通道上分了两小群细胞,C6仪器就是比较恶心,总是碰到各种各样奇怪的问题。后来我才注意到了坐标的值的大小
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 楼主| 发表于 2017-10-20 16:48:42 | 显示全部楼层
家的感觉 发表于 2017-10-20 10:57
一般只有C6的坐标才能到10的7次方

原来如此
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 楼主| 发表于 2017-10-20 16:49:47 | 显示全部楼层
ghqiu09 发表于 2017-10-20 14:49
我倒是先看到的是楼主7AAD-2图上,三通道上分了两小群细胞,C6仪器就是比较恶心,总是碰到各种各样奇怪的 ...

是啊,好奇怪,为什么就分出两小群了?请问这有办法避免吗?
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