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[流式相关软件] 观测病毒感染的可以表达EGFP蛋白的细胞占总细胞的比例

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发表于 2019-6-5 15:20:34 | 显示全部楼层 |阅读模式
1流星
我想探究痘病毒对于某基因表达差异的细胞(通过RNAi获得)是否具有不同的侵染能力,于是用1感染复数(一个病毒平均侵染一个细胞)的病毒处理细胞,在荧光显微镜下观测到绿色荧光后收样上流式,同时以未被感染的细胞作为对照,怎样才能计算出表达EGFP的细胞占总细胞数的比例呢。未被感染的细胞在FITC通道也会有峰值出现,通过什么方法可以将背景消除

 楼主| 发表于 2019-6-5 15:34:45 | 显示全部楼层
这是导出的图片,1,2是加过病毒的,3,4是没加病毒的对照
图1.png
图2.png
图3.png
图4.png
 楼主| 发表于 2019-6-5 15:36:19 | 显示全部楼层
类似的,我想计算m2区域的百分比,应该如何处理数据
发表于 2019-6-6 08:41:52 | 显示全部楼层
yichuanzimu 发表于 2019-6-5 15:34
这是导出的图片,1,2是加过病毒的,3,4是没加病毒的对照

未加病毒的这个单峰,是本底啊,正常的啊。
你只要看M2的比例,就是转染率
 楼主| 发表于 2019-6-6 12:36:10 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2019-6-6 08:41
未加病毒的这个单峰,是本底啊,正常的啊。
你只要看M2的比例,就是转染率 ...

所以按照我图上的方法,在本底后面直接选择区域来看感染率的方法是可以的对吧,谢谢老师
发表于 2019-6-7 08:25:18 | 显示全部楼层
yichuanzimu 发表于 2019-6-6 12:36
所以按照我图上的方法,在本底后面直接选择区域来看感染率的方法是可以的对吧,谢谢老师 ...

不,GFP转染后,可以非常漂亮地分成两个峰,高的峰就是阳性。
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