找回密码
 加入流式中文网

QQ登录

只需一步,快速开始

流式中文网 门户 查看主题

关于流式细胞多色方案中涉及到的spillover和spread

发布者: 骑猪上高速 | 发布时间: 2024-9-15 18:50| 查看数: 949| 评论数: 0|帖子模式

亲爱的FLOWER,加入流式中文网,一起讨论,一起学习,享受更多福利吧!

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?加入流式中文网

×
前两天看到公众号转发的贝克曼库尔特生命科学的《Spillover vs. Spread:破解精准流式多色分析的斯芬克斯之谜》,看完还是有点疑惑,问了一下GPT,感觉它的更加通俗易懂,在此分享一下。
在流式细胞术的多色实验中,spilloverspread 是两个关键的概念,它们描述了荧光染料之间的相互干扰和误差。为了更通俗地理解,我们可以将其比作光谱中的“串色”和“光散射”。

1. Spillover(溢出)通俗点说,spillover 可以理解为不同荧光染料在各自通道内“串色”的现象。假设你在检测不同的荧光染料,每个染料都有一个主检测通道,但由于荧光染料的光谱重叠,它可能会在不属于它的检测通道中产生信号。就像在一个乐队演奏时,本应只在一个麦克风中听到吉他声,但你可能也在鼓的麦克风中听到了一些吉他声,这就是“溢出”。
具体例子:
  • 比如你使用了两个染料A和B,A主要发射绿光,B发射红光。如果你在检测A的通道(绿色荧光通道)时,B的红光也稍微“串”进来了,这就是spillover。每种染料的信号可能“溢出”到其他通道,导致测量的值并不仅仅来自目标染料。
2. Spread(扩散)spread 则可以理解为由于 spillover 造成的噪音或不确定性。换句话说,即使通过数学方法校正了不同荧光染料之间的信号溢出,溢出引入的测量误差仍然存在,导致检测通道中的信号扩散,这种现象就是 spread。
举个通俗的例子:如果我们把每个染料的检测看作是画线,spillover 就是“线不直”,而 spread 就是“线有点模糊”。尽管我们可以校正 spillover 使信号尽量准确,但spread代表的是噪音或不确定性,它使数据点之间的界限不如理想状况那样清晰。
如何更好地理解两者的关系?
  • Spillover 是指荧光染料本身信号串入了其他通道,这部分是可以通过数学校正(如补偿)来解决的。
  • Spread 是在 spillover 校正后,依然存在的测量误差,无法完全消除。这种误差会影响荧光信号的精度,使得两个不同染料之间的区分不如预期那么清晰。
实际影响在实际的流式细胞术实验中,如果没有良好的补偿或染料选择不当,spillover 会导致各个通道的信号变得难以区分。即使进行了补偿,spread 依然会影响结果,使得你在多色流式实验中区分不同荧光信号更加困难。
总结一下:
  • Spillover 是染料之间的光谱重叠,导致信号串入其他通道;
  • Spread 是这种重叠导致的噪声和不确定性,影响了结果的准确性。







评分

参与人数 1流星 +2 收起 理由
niwanmao + 2 感谢分享

查看全部评分

最新评论

手机版|流式中文网 ( 浙ICP备17054466号-2 )

浙公网安备 33038202004217号

GMT+8, 2024-12-22 01:09

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表