细胞周期及Flowjo数据处理

pigdennis · 发表于 2011-8-9 08:28:13

本帖最后由 pigdennis 于 2011-8-9 08:29 编辑

这是我用Flowjo做的时候截的图，最后的直方图第二个峰离400比较远 watson模型无法计算
用modfit的话也是这样，但可以计算，只不过拟合的非常不好。
我想请问在手动分析的时候，是把第二个峰当作G2呢还是在400附近，比如350-450做gate设为G2

还有一个问题：用Flowjo分析细胞周期，G1＋G2＋S！＝100，那最后发表数据的时候怎么处理
感谢达人解答！

niwanmao · 发表于 2011-8-9 08:56:25

pigdennis 发表于 2011-8-9 08:28

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这是我用Flowjo做的时候截的图，最后的直方图第二个峰离400比较远 watson模型无法计算
用modfit的话 ...

个人建议：flowjo的细胞周期分析功能不好，建议用modfit。
一般，G2和G1的峰值比不是2.0的话，可能跟标本处理、标本获取时未调整到位等因素有关，也可能前两者都没问题，只是标本获取时本身的一个变异度。

modfit拟合不好，说明G2和G1的比值离2.0有点远，可以打开设置，把这个默认G2/G1的2.0改为1.7或1.8，然后再不断调整G2和G1的位置，直至拟合完美。

leisong12 · 发表于 2011-8-9 15:58:04

flowjo峰值不一定在400的, 把第二个峰认为是G2期就可以了.

pigdennis · 发表于 2011-8-9 16:11:59

回复 leisong12 的帖子

但是watson模式无法计算，那是不是手动把第二个峰gate设成G2即可？

leisong12 · 发表于 2011-8-9 16:15:37

用另一个模式计算,手动调G1峰和G2峰位置

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