新手ModFit分析人MSC细胞周期

perfect111 · 发表于 2023-4-12 16:57:03

新手第一次用ModFit分析细胞周期数据，不知道问题出在哪，希望大佬指导一下

分析步骤如下

niwanmao · 发表于 2023-4-12 20:26:10

G2期，需要手动定位。

PS：以后上传图片，请务必通过编辑器的工具栏上图片按钮上传，不是直接粘贴图片进去。刚才我已经帮你修正过了，现在图片可正常显示。

wxd · 发表于 2023-4-13 08:22:47

已经手动去除黏连细胞和碎片的，可以关掉debris和aggregates。另外PI染色分析细胞周期，除了可以用PE-A通道，PE-H、PerCP-A和PerCP-H通道也可以用来分析。根据我的的工作经验，使用PerCP通道分析细胞周期得到的结果会好于PE通道。

perfect111 · 发表于 2023-4-14 22:02:54

niwanmao 发表于 2023-4-12 20:26
G2期，需要手动定位。

PS：以后上传图片，请务必通过编辑器的工具栏上图片按钮上传，不是直接粘贴图片进去 ...

好的，谢谢老师，记住了

perfect111 · 发表于 2023-4-14 22:03:48

wxd 发表于 2023-4-13 08:22
已经手动去除黏连细胞和碎片的，可以关掉debris和aggregates。另外PI染色分析细胞周期，除了可以用PE-A通道 ...

嗯嗯，好的，谢谢您，我回头试试

wmj123456 · 发表于 2023-9-17 21:49:34

本帖最后由 wmj123456 于 2023-9-17 21:51 编辑

wxd 发表于 2023-4-13 08:22
已经手动去除黏连细胞和碎片的，可以关掉debris和aggregates。另外PI染色分析细胞周期，除了可以用PE-A通道 ...

前辈，能否请教个modfit拟合的问题，如果选择自动拟合，RCS和CV值符合要求，就可以了吧？我的样本用自动拟合后，图例中显示G1和G2期都是红色的，但是直方图中红色的区域是在G1的位置，G2位置为什么没有看到红色？
另外还想请教下，在mod模式中，numbers of cycles，我选择1和2，拟合出来的图形还是不一样的，如果确定样本是2倍体，就是选择1了吧

niwanmao · 发表于 2023-9-18 08:05:20

wmj123456 发表于 2023-9-17 21:49
前辈，能否请教个modfit拟合的问题，如果选择自动拟合，RCS和CV值符合要求，就可以了吧？我的样本用自动拟 ...

确定样本是二倍体，number of cell cycles应选择1，否则拟合出来，会把G2/M期当成异倍体的G0/G1峰了，也就导致你看不到二倍体的G2/M峰

wmj123456 · 发表于 2023-9-18 10:15:36

niwanmao 发表于 2023-9-18 08:05
确定样本是二倍体，number of cell cycles应选择1，否则拟合出来，会把G2/M期当成异倍体的G0/G1峰了，也 ...

倪老师，number of cell cycles是1，然后点击fit，但是拟合出来后，还是没有看到2倍体的G2/M峰，这是为啥啊？在点击fit之前，能看到，第一张是图是fit之前的图，第二张图是fit之后的图，是我哪个步骤没有做对吗？

niwanmao · 发表于 2023-9-18 12:17:28

wmj123456 发表于 2023-9-18 10:15
倪老师，number of cell cycles是1，然后点击fit，但是拟合出来后，还是没有看到2倍体的G2/M峰，这是为啥 ...

目前你设置的G2/G1是2.00，实际上你获取的G2/G1没有到2.00，所以根据峰所在的位置估算一下MFI，算一下比值，按此比值往下调一点

wmj123456 · 发表于 2023-9-18 23:19:30

niwanmao 发表于 2023-9-18 12:17
目前你设置的G2/G1是2.00，实际上你获取的G2/G1没有到2.00，所以根据峰所在的位置估算一下MFI，算一下比 ...

倪老师，我把G2/G1改为1.8后，拟合的图形变正常了，原来要根据实际的G2/G1的值在软件上修改G2/G1的值啊。还有想问下，直方图中的两个黑色的三角所处的位置，是代表什么意思？是代表最初我调节电压的时候，G1和G2所处的位置吗？是固定不变的吧？

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