细胞群位置改变

瓜瓜999

测皮下肿瘤的免疫细胞，有2组老鼠 （A组，B组）。Day1杀了A，B组各两只，跑了流式。Day2又杀了A，B组另外两只跑流式

发现Day1的老鼠样本细胞群都偏向左 （例如sample 1的位置)， 但是Day2细胞群都偏向右 （例如sample 2)。
后续分析Ly6c monocytes和F4/80 macrophages的亚群，我发现Day2相对Day1的细胞群也是偏向右。

请问这是什么原因？

niwanmao

先确认仪器的稳定性（每台仪器都有质控微球）
其次确认染色条件（如抗体量、洗涤力度等）和操作是否稳定（可用前一天的sample1做平行比对）

一般说来，都是操作的问题可能性更大

瓜瓜999

niwanmao 发表于 2024-6-10 13:44
先确认仪器的稳定性（每台仪器都有质控微球）
其次确认染色条件（如抗体量、洗涤力度等）和操作是否稳定（ ...

老师您指的平行比较是什么意思呢，是指比较同一天的样本吗？同一天做的样本位置基本一致，只是不同天做的不一样。
我也觉得应该是操作的问题。 但是不知道到底哪个位置可信。如果圈门位置保持不变，sample1里的F4/80数量少，但是sample2的多

niwanmao

瓜瓜999 发表于 2024-6-10 16:32
老师您指的平行比较是什么意思呢，是指比较同一天的样本吗？同一天做的样本位置基本一致，只是不同天做的 ...

平行对比，以你上面的为例，你发现前一天sample1的位置是好的，那么第2天做sample2的时候，把sample1也同时再做一次，这就是平行对比，看sample1的位置是跟sample2一样偏掉了？还是跟昨天一样？

如果平行对比两者都偏了，可能性大的还是仪器或者操作中存在不稳定因素，需逐一排查。
如果平行对比时sample1和昨天一样，而sample2偏了，则说明sample2的问题。

瓜瓜999

niwanmao 发表于 2024-6-11 08:46
平行对比，以你上面的为例，你发现前一天sample1的位置是好的，那么第2天做sample2的时候，把sample1也同 ...

谢谢老师的建议~