purdue的两款免费流式分析软件（CYTOSPEC和PlateAnalyzer）

niwanmao

上次@dragonhzqsmmu 提到purdue大学的PlateAnalyzer，高通量批量分析，于是去看了下，发现还有一个cytospec。

cytospec是单个文件的流式分析程序，感觉可能跟@haven_t 的CFCS一样都是C语言编的，其特点就是集成了PCA（主成份分析），可能在某些情况能够更简单地将细胞用主成份区分开来，但我用了下，觉得对多个文件的分析支持不是很好，例如你同时打开两个文件，此时进行分别进行PCA计算，于是两个文件的PCA就混起来，乱套了。不过该软件目前还是1.0.0，以后应该还会改进的。

CYTOSPEC截图

下载链接：For 32 bit you need the EXE file (download now). For 64 bit use this EXE file (Download now).
使用视频教程：

1. Demo 1 -Basic introduction

2. Demo 2 -Tabloid output

3. Demo 3 -  PCA - how to apply it\

4. Demo 4 -  More PCA

5. Demo 5 - Some Utility Features

6. Demo 6 - More Utility Features

7. Demo 7 - Create a new FCS file and perform PCA on it

PlateAnalyzer只针对科研院校或公司应用于研究性的目的，故需向jpr@flowcyt.cyto.purdue.edu 发送邮件申请。该软件主要用于高通量的流式数据分析，由于需要申请，故没有去试用。
教程（其中部分教程缺失，可能作者没录制或其它原因没放出来）：

1. The quick 45 sec demo (play)

2. instant gates (play)

3. Basic analysis (download now) (23.8 megs)

4. Exporting data in CSV format (play)

5. New Drugbox controls (Play)

6. Logic Map  (Play)

7. Wells with no cells video! (play)

8. AutoUpdate feature (play) auto%20updates.wmv

9. Enhanced features March 2012 (play)

10. SMILES codes read for drugs see

11.  New DRUGBOX Controls features

12. Export CSV data files

13. Dealing with Empty Wells

14. 40 PLUS parameter data CyTOF analysis

15. Autowell finder-extracting single wells from large files