小鼠骨髓及脾脏原始数据分析

十二郎

各位好   附件中有小弟做的流式结果，附带有参考文献中的定义及图形。这是不同基因型的小鼠，骨髓中在FSC与SSC设门的时候，有时候会出现不一样的淋巴群，这时候就比较纠结于设置淋巴门的大小，及B220高低表达的问题。望大神能答疑解惑帮忙分析下。谢谢{:soso__10169062262133571330_1:}

niwanmao

用了11－25 BM标本分析了下，感觉应该如下设门，至于B220的hi和lo确实很难区分，文章中的图也是一团的，只能按照中间分界来大致圈：

十二郎

niwanmao 发表于 2014-12-14 22:22
用了11－25 BM标本分析了下，感觉应该如下设门，至于B220的hi和lo确实很难区分，文章中的图也是一团的，只 ...

谢谢倪老师的指点  我想再问一句   当参考已知文献进行设门的时候，若是细胞群与定义不是很符合的话，尤其是B细胞分群时的高低表达之分不明显时，是不是可以参考文献中的对照组的分群比列进行分群，然后对所有样本应用同一个门进行批量化处理呢？   因为我认为这时候可以有一个相对稳定的标准。 还有就是当对照鼠是不同背景时，不同背景对照鼠之间的细胞分群会不会有一些差别呢？问题有点多，谢谢啦

niwanmao

十二郎 发表于 2014-12-16 20:11
谢谢倪老师的指点  我想再问一句   当参考已知文献进行设门的时候，若是细胞群与定义不是很符合的话，尤 ...

再找找别的参考文献，如果都是这样的图形，可以参考他们的位置进行在中间位置划门，将阳性细胞群分为两部分。

十二郎

niwanmao 发表于 2014-12-16 20:45
再找找别的参考文献，如果都是这样的图形，可以参考他们的位置进行在中间位置划门，将阳性细胞群分为两部 ...

也试着采用其他文献的定义设门，但是文献中B细胞亚群的定义有很多种，就是一个亚群就会有几种定义。对于同一个亚群，比如说matureB，有时候采用B220+IgM+的时候没有差别，采用另一种定义B220+CD43-IgM+的时候就会有差异，这时候比较纠结，请问倪老师应该怎么办呢？

niwanmao

十二郎 发表于 2014-12-16 23:19
也试着采用其他文献的定义设门，但是文献中B细胞亚群的定义有很多种，就是一个亚群就会有几种定义。对于 ...

一般我是这么想的，标记越多，那么鉴定的细胞亚群会越细，如果B220+CD43-IgM+也是公认的，那么我更倾向于这种更多标记的组合。

niwanmao

十二郎 发表于 2014-12-16 23:19
也试着采用其他文献的定义设门，但是文献中B细胞亚群的定义有很多种，就是一个亚群就会有几种定义。对于 ...

一般我是这么想的，标记越多，那么鉴定的细胞亚群会越细，如果B220+CD43-IgM+也是公认的，那么我更倾向于这种更多标记的组合。

十二郎

niwanmao 发表于 2014-12-17 12:56
一般我是这么想的，标记越多，那么鉴定的细胞亚群会越细，如果B220+CD43-IgM+也是公认的，那么我更倾向于 ...

好的   明白了   非常感谢倪老师的耐心指导  谢谢