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[标本处理] flowjo处理293T细胞后,最左边出现的细胞是什么,求解答?

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发表于 2016-11-2 14:19:11 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星未解决
293T细胞上机后,处理结果时,正确的圈门,设置相应的荧光,在选用伪彩图时,问题细胞并看不到,但是换成等高图后,就很明显的看得到,具体看附图,望解释这些是什么细胞?是什么原因造成的?对结果的影响有多大干扰?如何去掉这些细胞?处理结果或是上机该做哪些改进?谢谢!


前项后项图

前项后项图

处理后的伪彩图

处理后的伪彩图

等高图和问题细胞

等高图和问题细胞

























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发表于 2016-11-2 15:42:32 | 显示全部楼层
这种信号应该是很少的,可能是电子噪音或者液路中的污染物信号
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 楼主| 发表于 2016-11-2 16:09:25 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-11-2 15:42
这种信号应该是很少的,可能是电子噪音或者液路中的污染物信号

倪老师,这种信号在我这大部分都存在,包括T细胞也存在同样的问题?像频繁出现这种情况,电子噪音或污物信号还是这个原因吗?包括不同流式仪的结果,也会出现。
截图未命名l.jpg
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 楼主| 发表于 2016-11-2 16:10:12 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-11-2 15:42
这种信号应该是很少的,可能是电子噪音或者液路中的污染物信号

这种信号对结果的影响大吗?
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发表于 2016-11-2 16:55:35 | 显示全部楼层
maomao 发表于 2016-11-2 16:10
这种信号对结果的影响大吗?

因为你设门的时候,肯定会用某个特异性标记去圈,所以基本上可以去光,少量干扰也不会影响的。
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 楼主| 发表于 2016-11-2 17:01:28 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-11-2 16:55
因为你设门的时候,肯定会用某个特异性标记去圈,所以基本上可以去光,少量干扰也不会影响的。 ...

倪老师,没有特异性标记圈门,根据的是目的细胞群的位置来圈门,所以大部分都存在这种干扰信号,我需要怎么处理,来去掉这种干扰信号?
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发表于 2016-11-2 18:03:42 | 显示全部楼层
maomao 发表于 2016-11-2 17:01
倪老师,没有特异性标记圈门,根据的是目的细胞群的位置来圈门,所以大部分都存在这种干扰信号,我需要怎 ...

你要圈目的细胞群,肯定有设门抗体啊,所以用设门抗体是可以排除掉这些信号的。
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 楼主| 发表于 2016-11-3 09:28:01 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-11-2 18:03
你要圈目的细胞群,肯定有设门抗体啊,所以用设门抗体是可以排除掉这些信号的。 ...

倪老师,真没有用专门设门的抗体。做的细胞是单一细胞群,比如说293T细胞,就是单一的这种细胞,所以流式上机很明显,只有这个细胞群,圈门就很方便呀,后选择需要检测的孵育相应抗体的荧光信号,得出所谓的”阳性率“,如最初的三张图。所以照这样还是不能去掉这种信号。
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发表于 2016-11-3 19:36:52 | 显示全部楼层
maomao 发表于 2016-11-3 09:28
倪老师,真没有用专门设门的抗体。做的细胞是单一细胞群,比如说293T细胞,就是单一的这种细胞,所以流式 ...

通过反设门,看看这类信号分布在哪个位置,是否能单独排除掉,如果实在排除不掉,就不用管它了,因为比例确实低。
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 楼主| 发表于 2016-11-4 08:58:44 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-11-3 19:36
通过反设门,看看这类信号分布在哪个位置,是否能单独排除掉,如果实在排除不掉,就不用管它了,因为比例 ...

好的,谢谢老师
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