流式分析中问题

lsj1988

我的目的是脂肪组织巨噬细胞M0，M1，M2分类，经过老师调调压和补偿，我跑了试验管，回来分析会发现如图，各门均有flowjo提示30-60% Event are in the chart edge！！

这个提示是否是说明电压调的太小了，把细胞都压缩到边缘了，导致最后分析数据损失了一大部分细胞？

1、SSC-FSC,中细胞有时候过密，不知道如何区分单核细胞？
2、存在图3，cd11b与f480的问题，Event are in the chart edge！！这个该如何处理？

niwanmao

1、我一直认为，如果你要圈某类细胞，一定要加一个系列特异性抗体。如果细胞太多，可以临时减少显示的细胞数量实现，FlowJo可以调的。
2、这种贴边，是没关系的，可以象你第二张图的第三个图形那样，采用双指数显示。

lsj1988

niwanmao 发表于 2018-8-11 15:42
1、我一直认为，如果你要圈某类细胞，一定要加一个系列特异性抗体。如果细胞太多，可以临时减少显示的细胞 ...

按照倪老师的说法，我第二个图的第一个gate，其实无需纠结我选哪些，我只要把所有的细胞群圈上，然后通过F4/80和CD11B双阳的细胞来挑我的巨噬细胞，而不一定要从第一个gate中挑选出哪些是单核细胞?是这样理解吗？

双指数形式怎么调节flowjo，我得再研究一下。

谢谢倪老师答复，还期待您继续解答！