FlowJo分析细胞周期的问题

steven

大家好，之前做细胞周期得到的数据想用flowjo分析一下，但是拟合不上，不知道大家有没有遇见过。
正常划门之后，PI值的图如1所示，G1应该在1000的位置，但是对这部分细胞进行周期分析的时候，G1就跑到10000的位置了。
通过调节PI图的横轴，细胞周期上的图也相应移动，但都是不能和PI图像完全一样，而且也拟合不上周期，手动划了G1，G2区域后拟合出来的图也完全不对。不知道这是什么原因。

图1

图2

niwanmao

可通过设置G1peak和G2peak的峰位置。
但是还是建议用Modfit来分析，而不是flowjo。

steven

niwanmao 发表于 2021-7-29 19:05
可通过设置G1peak和G2peak的峰位置。
但是还是建议用Modfit来分析，而不是flowjo。 ...

手动划了P1 peak和P2 peak，最后也拟合不上。
看大家别的帖子讨论确实flowjo细胞周期分析不太好用，可是没有买Modfit啊，用不了。

如果只是想对比P1的细胞比例，可以自己手动划门吗，看P1位置细胞的比例？虽然没有软件分析的那么准确，但是不是可以作为替代手段呢？

steven

刚才自己又尝试了一下，将PI轴设置成Linear，然后调节轴的范围之后，可以顺利的拟合上了。感谢倪老师的回复。

niwanmao

steven 发表于 2021-7-30 09:50
刚才自己又尝试了一下，将PI轴设置成Linear，然后调节轴的范围之后，可以顺利的拟合上了。感谢倪老师的回复 ...

PI是要线性坐标的。找到原因就好，前面我也没关注坐标轴，还是你自己钻研的好