请教Flowjo中的Downsample问题

刘小六

大家好，请教一个问题：我用Flowjo downsample CD45这群细胞之后，拖动应用到all sample时，显示出图1提示，最终也无法应用全部（如图2）。请问是什么原因有人碰到过吗？

niwanmao

Downsample不算一个门，所以批量应用肯定会存在问题的。
建议将门批量应用后，再对其进行逐一downsample吧。

刘小六

niwanmao 发表于 2022-6-6 21:41
Downsample不算一个门，所以批量应用肯定会存在问题的。
建议将门批量应用后，再对其进行逐一downsample吧 ...

好的倪老师，因为病例样本数太多啦，以为可以批量应用偷懒了

18804313936

niwanmao 发表于 2022-6-6 21:41
Downsample不算一个门，所以批量应用肯定会存在问题的。
建议将门批量应用后，再对其进行逐一downsample吧 ...

倪老师您好！请问您的意思可以理解为，先在不同样本上圈门，再在各组样本目标亚群使用Downsample嘛？这样操作与直接将各组样本Downsample后再圈门有什么区别呢？谢谢倪老师！

niwanmao

18804313936 发表于 2022-8-7 16:41
倪老师您好！请问您的意思可以理解为，先在不同样本上圈门，再在各组样本目标亚群使用Downsample嘛？这样 ...

Downsample随机采样，所以对于数据点来说，可能是不一样，但统计数字应该不会相差太大。