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利用磷酸化流式细胞术检测PBMC信号转导(资源)

2017-1-3 22:46| 发布者: wendy1975| 查看: 932| 评论: 12|原作者: niwanmao

摘要: PBMC中存在的各类免疫细胞是异质性的,单单CD4+T细胞就存在数十种功能亚群。各类信号(如细胞因子、趋化因子、各种受体配体结合、T或B细胞受体连接)介导的信号转导代表着免疫细胞之间存在一些重要的关联,而PBMC中 ...
PBMC中存在的各类免疫细胞是异质性的,单单CD4+T细胞就存在数十种功能亚群。各类信号(如细胞因子、趋化因子、各种受体配体结合、T或B细胞受体连接)介导的信号转导代表着免疫细胞之间存在一些重要的关联,而PBMC中的各类免疫细胞,其信号转导的方式各式各样。如果不分细胞亚群,直接用PBMC整体作为研究对象,会模糊各类细胞之间信号转导的差异性,因此,在单个细胞水平进行不同种类免疫细胞信号转导研究是十分必要的。

Gary Nolan博士及其团队是将流式细胞术结合磷酸化蛋白抗体应用于单细胞水平信号转导研究的先驱,他们将此技术命名为磷酸化流式细胞术,即phosflow。在phosflow中,用信号受体配体和/或其它拮抗剂刺激PBMC或其它细胞一段时间,然后用多聚甲醛固定细胞,使其稳定在磷酸化的状态,然后破膜,以荧光标记的针对磷酸化蛋白的抗体染色,并辅以其它标记区分不同细胞群体,最后上机分析。

利用phosflow,我们可以通过STAT家族的磷酸化水平分析各种细胞因子的作用,以及分析T细胞受体和B细胞受体活化后、Toll样受体联结后下游分子(如NF-κB p65、ERK、p38、ZAP70等)磷酸化改变。下图就是一个p38蛋白在不同刺激条件下的磷酸化表达改变情况。
p38的磷酸化水平检测

优化磷酸化检测方法时有以下几点需要考虑:
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1、选择合适的破膜方法。Nolan及其团队发布的方法是固定细胞后采用100%甲醇破膜,这是最常用的方法,用该方法的优点是甲醇固定后,细胞可保存在-20℃或-80℃很长时间,这样你就可以在不同时间进行标本刺激、收集,最后一起标记和检测磷酸化蛋白,可以减少不同次实验之间的差异。此外,还有不少相关的适合磷酸化蛋白检测或其它抗原的商业化缓冲液,也是可以考虑的。
2、选择合适的目标抗原,以区分出目的细胞群。某些抗原可能在破膜过程中,受到破膜剂甲醇或其它试剂影响而被破坏,例如在用CD19区分B细胞或CD14区分单核细胞时,就受甲醇影响很明显,此时可分别改用CD20和CD33,就能取得很好的效果。



Cytobank是Gary Nolan实验室为了磷酸化检测而设计的网站(当然,现在还增加了在线数据存储和分析功能),有助于我们选择磷酸化检测的合适的抗原和克隆号。上面会列出一些用BD破膜剂测试成功或不成功的例子。
总之,phosflow是分析信号转导事件的非常好的方法,对单细胞磷酸化水平及信号转导检测的深入,可提高我们对免疫系统复杂性的认识。


Nolan实验室的Phosflow protocol:
Single-cell phospho-protein analysis by flow cytometry. Schulz KR, Danna EA, Krutzik PO, Nolan GP.Curr Protoc Immunol. 2012 Feb;Chapter 8:Unit 8.17.1-20.
BD Biosciences Phosflow主页:
http://www.bdbiosciences.com/res ... p?WT.ac=FP_Phosflow
Cytobank用各类破膜缓冲液测试的抗体列表:
http://www.cytobank.org/facselect/

深入阅读:
Flow cytometric analysis of cell signaling proteins. Suni MA, Maino VC. Methods Mol Biol. 2011;717:155-69.
Single-cell, phosphoepitope-specific analysis demonstrates cell type- and pathway-specific dysregulation of Jak/STAT and MAPK signaling associated with in vivo human immunodeficiency virus type 1 infection. Lee AW, Sharp ER, O'Mahony A, Rosenberg MG, Israelski DM, Nolan GP, Nixon DF. J Virol. 2008 Apr;82(7):3702-12.


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最新评论

引用 dragonhzqsmmu 2013-6-11 13:30
国内这方面开展的老师多不多?如果可行的话,可以解决部分Western blot的难题了
引用 niwanmao 2013-6-11 13:51

肯定有。但是成本、检测的蛋白种类是限制性因素
引用 椴树 2013-6-24 21:46
niwanmao 发表于 2013-6-11 13:51
肯定有。但是成本、检测的蛋白种类是限制性因素

老师BD网站上用于流式的磷酸化抗体种类不多,在其它公司买的未写明可以用于流式的磷酸化抗体能用么?用于流式的磷酸化抗体有什么特别要求么?是不是也是要天然构象的抗原免疫的抗体而不能线性多肽免疫的抗体啊?那这样的话能用来做免疫荧光的抗体应该能用来做流式吧
引用 niwanmao 2013-6-24 21:54
椴树 发表于 2013-6-24 21:46
老师BD网站上用于流式的磷酸化抗体种类不多,在其它公司买的未写明可以用于流式的磷酸化抗体能用么?用于 ...

BD网站上的应该都是直标的磷酸化抗体。如果采用间标的方法,我觉得santa、cell signal等公司的都可以试试,但是如果未写明流式可用,就需要与western blot进行比较方可知道效果。
另一个方法就是可以搜索文献,看看是否曾有人将该抗体应用于流式。
流式的抗体应该都是针对天然构象的吧
引用 椴树 2013-6-24 22:05
niwanmao 发表于 2013-6-24 21:54
BD网站上的应该都是直标的磷酸化抗体。如果采用间标的方法,我觉得santa、cell signal等公司的都可以试试 ...

有看到膜蛋白的用来做流式的抗体是用胞外一段多肽序列做抗原免疫的
引用 niwanmao 2013-6-24 22:07
椴树 发表于 2013-6-24 22:05
有看到膜蛋白的用来做流式的抗体是用胞外一段多肽序列做抗原免疫的

能给个链接吗?
引用 椴树 2013-6-24 22:14
niwanmao 发表于 2013-6-24 22:07
能给个链接吗?

http://www.abcam.cn/CFTR-antibody-CF3-ab2784.html
不过说是只有通透细胞才能检测到http://www.abcam.cn/CFTR-antibody-CF3-ab2784/questions/70965
引用 niwanmao 2013-6-24 22:36
椴树 发表于 2013-6-24 22:14
http://www.abcam.cn/CFTR-antibody-CF3-ab2784.html
不过说是只有通透细胞才能检测到http://www.abcam.c ...

哦,你是指这个片段,这个所有的抗体都应该是用针对某个片段(即位点)的免疫原打出来的啊。这个所有的抗体制备都是一样的,不需要去关心它,要关心的是抗体结合的位点,正常情况下是否是可结合的。象你说的这个链接中,是由于抗体要结合的位点在一般情况下未暴露,经过破膜后方才暴露,跟抗体怎么打出来是无关的。
引用 椴树 2013-6-24 22:40
niwanmao 发表于 2013-6-24 22:36
哦,你是指这个片段,这个所有的抗体都应该是用针对某个片段(即位点)的免疫原打出来的啊。这个所有的抗 ...

奥 明白了 谢谢老师
引用 xiaoC 2013-8-5 09:15
这个网站太给力了!
引用 生物菌 2019-1-20 23:28
老师,用流式的磷酸化抗体检测我出现和WB不一样的结果,感觉很奇怪,不过用的是BD的P-stat3检测小鼠CD4细胞刺激以后的
引用 niwanmao 2019-1-21 14:36
生物菌 发表于 2019-1-20 23:28
老师,用流式的磷酸化抗体检测我出现和WB不一样的结果,感觉很奇怪,不过用的是BD的P-stat3检测小鼠CD4细胞 ...

这个很难判断,因为不知道是WB出问题,还是你在流式检测的时候出问题。

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