同型对照所在的门和目的细胞群所在的门必须一致吗？

wli123

倪老师好，还想向您请教一个问题。我用同型对照的时候，同型对照所在的门和目的细胞群所在的门必须一致吗？

如下图：
左边同型对照是淋巴门里的，右边分析的是FL1单阳门里的，这样可以吗？还是要求同型对照也必须是在FL1单阳门里的？


谢谢倪老师！

niwanmao

同型对照之前发过很多帖子，反复说明用于设门，其实很多时候会出现不少问题，因为很难选到真正合适的同型对照。

wli123

niwanmao 发表于 2022-11-23 21:00
同型对照之前发过很多帖子，反复说明用于设门，其实很多时候会出现不少问题，因为很难选到真正合适的同型对 ...

嗯，我看过不少帖子，您说最好是用生物学阴性对照设门。比如我提取人外周血PBMC，但测的是淋巴细胞表面的marker，这个marker不在粒细胞表达。我就用粒细胞圈个门，看这个marker的阴性位置。这算是生物学阴性对照吗？



如上图：第1个图和第2个图是粒细胞圈门后，界定FL2的阴性线，第3个图是用这个阴性线去界定淋巴门里的FL2阴阳分群。

但是有人告诉我说，对于相同marker，不同细胞的阴性位置可能不一样，用粒细胞圈门界定淋巴细胞的阴性线不合适。这样说有道理吗，倪老师？