为什么我的流式图统计表中，平均荧光强度会出现负值？

niwanmao

有站友发现，流式数据转换（双指数、Logicle、Hyperlog 等）后，常会显示负值。大家就会在想，为什么荧光强度会出现负值？负值有意义吗？


我们先来看看，负值究竟是怎么产生的。

实际上，我们在流式图上看到的，并非是真实的荧光绝对值，而是经过仪器固件和软件校正后的测量值，也就是说，该测量值是实际荧光值减去“基线”值得到的结果。 然而，实际荧光值和基线值的测量都存在误差。 因此，对于“阴性”细胞（荧光很少或没有荧光的细胞），由于这些误差的存在，导致实际荧光值可能会小于基线的测量值，那么相减后，最终测量值就会小于零。
同样，由于补偿的存在，来自所有补偿通道的测量误差也会被汇入最终计算值，也会导致相关通道检测值小于零。

因此，我们最后再来总结一下，荧光强度的负值，并不是双指数、Logicle、Hyperlog等算法计算的结果，而是由于扣除基线值、补偿这两类原因引起的。

如果你在分析时进行了过度补偿，或者设门时主要选择了荧光强度小于零的事件，那么对该群体的的任何统计值（中位数、平均值、几何平均值）都将为负数。
如果这些统计值远远小于零，则存在过度补偿问题（此时的MFI将不可信）。
如果该值接近于零，那么可能只是偶然（结果仍是可信的）。