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[细胞周期] 新手ModFit分析人MSC细胞周期

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发表于 2023-4-12 16:57:03 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏4流星未解决
新手第一次用ModFit分析细胞周期数据,不知道问题出在哪,希望大佬指导一下

分析步骤如下
1.png 2.png 3.png 4.png 5.png 6.png


组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2023-4-12 20:26:10 | 显示全部楼层
G2期,需要手动定位。

PS:以后上传图片,请务必通过编辑器的工具栏上图片按钮上传,不是直接粘贴图片进去。刚才我已经帮你修正过了,现在图片可正常显示。
组织样本处理不好?流式中文网原研的魔滤®魔杵®套装,低成本解决,高质量收获
发表于 2023-4-13 08:22:47 | 显示全部楼层
已经手动去除黏连细胞和碎片的,可以关掉debris和aggregates。另外PI染色分析细胞周期,除了可以用PE-A通道,PE-H、PerCP-A和PerCP-H通道也可以用来分析。根据我的的工作经验,使用PerCP通道分析细胞周期得到的结果会好于PE通道。
流式中文网FlowGuard®流式专用保存液,无需冻存,稳定保护各类流式样本,从容完成实验
 楼主| 发表于 2023-4-14 22:02:54 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2023-4-12 20:26
G2期,需要手动定位。

PS:以后上传图片,请务必通过编辑器的工具栏上图片按钮上传,不是直接粘贴图片进去 ...

好的,谢谢老师,记住了
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 楼主| 发表于 2023-4-14 22:03:48 | 显示全部楼层
wxd 发表于 2023-4-13 08:22
已经手动去除黏连细胞和碎片的,可以关掉debris和aggregates。另外PI染色分析细胞周期,除了可以用PE-A通道 ...

嗯嗯,好的,谢谢您,我回头试试
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发表于 2023-9-17 21:49:34 | 显示全部楼层
本帖最后由 wmj123456 于 2023-9-17 21:51 编辑
wxd 发表于 2023-4-13 08:22
已经手动去除黏连细胞和碎片的,可以关掉debris和aggregates。另外PI染色分析细胞周期,除了可以用PE-A通道 ...

前辈,能否请教个modfit拟合的问题,如果选择自动拟合,RCS和CV值符合要求,就可以了吧?我的样本用自动拟合后,图例中显示G1和G2期都是红色的,但是直方图中红色的区域是在G1的位置,G2位置为什么没有看到红色?
另外还想请教下,在mod模式中,numbers of cycles,我选择1和2,拟合出来的图形还是不一样的,如果确定样本是2倍体,就是选择1了吧
自动拟合.png
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发表于 2023-9-18 08:05:20 | 显示全部楼层
wmj123456 发表于 2023-9-17 21:49
前辈,能否请教个modfit拟合的问题,如果选择自动拟合,RCS和CV值符合要求,就可以了吧?我的样本用自动拟 ...

确定样本是二倍体,number of cell cycles应选择1,否则拟合出来,会把G2/M期当成异倍体的G0/G1峰了,也就导致你看不到二倍体的G2/M峰
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发表于 2023-9-18 10:15:36 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2023-9-18 08:05
确定样本是二倍体,number of cell cycles应选择1,否则拟合出来,会把G2/M期当成异倍体的G0/G1峰了,也 ...

倪老师,number of cell cycles是1,然后点击fit,但是拟合出来后,还是没有看到2倍体的G2/M峰,这是为啥啊?在点击fit之前,能看到,第一张是图是fit之前的图,第二张图是fit之后的图,是我哪个步骤没有做对吗?
fit前.jpg
fit后.png
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发表于 2023-9-18 12:17:28 | 显示全部楼层
wmj123456 发表于 2023-9-18 10:15
倪老师,number of cell cycles是1,然后点击fit,但是拟合出来后,还是没有看到2倍体的G2/M峰,这是为啥 ...

目前你设置的G2/G1是2.00,实际上你获取的G2/G1没有到2.00,所以根据峰所在的位置估算一下MFI,算一下比值,按此比值往下调一点
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发表于 2023-9-18 23:19:30 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2023-9-18 12:17
目前你设置的G2/G1是2.00,实际上你获取的G2/G1没有到2.00,所以根据峰所在的位置估算一下MFI,算一下比 ...

倪老师,我把G2/G1改为1.8后,拟合的图形变正常了,原来要根据实际的G2/G1的值在软件上修改G2/G1的值啊。还有想问下,直方图中的两个黑色的三角所处的位置,是代表什么意思?是代表最初我调节电压的时候,G1和G2所处的位置吗?是固定不变的吧?
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