丢弃率和阈值的关系

wmj123456

请教下各位老师，在流式细胞仪上显示丢弃率的参数，我个人理解的是，如果丢弃的细胞多（这里面是包括目的和非目的细胞吗），那么丢弃率就高？但是有看到帖子说，如果丢弃率高的话，要降低丢弃率，建议适当增加阈值，那这时候岂不是丢弃的细胞更多了吗？（增加阈值，更多的细胞被切掉）是不是有些矛盾？现在一直没有理解丢弃率和阈值的关系。希望老师们帮忙解释一下，谢谢。

悠游

你指的是分选的仪器吧？没怎么用过，但我的理解是：
影响丢弃率的因素蛮多的，仪器状态，样本浓度和活率，分选模式等都会影响丢弃率，这些信息可以咨询厂家的技术支持或者试剂公司的技术支持呀，毕竟他们都有相关培训，而且对你的试剂和仪器状态更了解

niwanmao

首先声明，我未做过分选，但我的理解如下，请做过分选的FLOWER指正。

丢弃率= 阈值以上丢弃的细胞/收集的细胞数。并不包括阈值以下。

举个例子，阈值设在5000，此时有500个碎片，500个细胞，收集时丢弃600个信号，里面包括了500个碎片，丢弃率60％。当阈值增加到10000，此时只收到500个细胞，收集时最多就只丢弃了100个信号，丢弃率20％。

wmj123456

niwanmao 发表于 2023-5-10 11:09
首先声明，我未做过分选，但我的理解如下，请做过分选的FLOWER指正。

丢弃率= 阈值以上丢弃的细胞/收集的 ...

倪老师，为什么在阈值为10000的时候，丢弃的信号是变少了？是因为相比较5000阈值的时候，碎片减少了，所以总的丢弃粒子就减少了？

Sort events will be aborted if a cell is too close to its neighbor, and if a full charge cannot be applied to the drop. Thus, the critical factors influencing abort rates are the speed of the sample flow and the rarity of the population of interest.看到这样一段话。流速快，细胞浓度大，容易导致丢弃率高。

niwanmao

wmj123456 发表于 2023-5-11 23:57
倪老师，为什么在阈值为10000的时候，丢弃的信号是变少了？是因为相比较5000阈值的时候，碎片减少了，所以 ...

设置到了10000，被切除掉的碎片，就不属于丢弃的目标了，只有大于10000的数据点，才是丢弃的对象。明白了吗？


流速快，丢弃率高，这个更容易理解了，流速快，更容易形成湍流，更容易使信号偏离而丢失。

wmj123456

嗯嗯，明白了，倪老师，非常感谢

wmj123456

wmj123456 发表于 2023-5-12 08:34
嗯嗯，明白了，倪老师，非常感谢

对了，倪老师，还想请教您个问题，一个方案里做了4个指标，最前面是主细胞，DAPI（染死活）和FITC设门的比例都比较接近，但是在分析APC和PerCP的时候，一份样本两台仪器的结果有些差异，这可能是哪些因素导致的？能帮忙看看吗？

niwanmao

wmj123456 发表于 2023-5-12 08:40
对了，倪老师，还想请教您个问题，一个方案里做了4个指标，最前面是主细胞，DAPI（染死活）和FITC设门的比 ...

仪器配置不清楚，图上的荧光素也被你们抹去了后半部分，所以无法回答。

wmj123456

niwanmao 发表于 2023-5-12 09:48
仪器配置不清楚，图上的荧光素也被你们抹去了后半部分，所以无法回答。 ...

倪老师，不好意思，我本来是想隐去指标信息的，没有涂抹好，图上的荧光素，第一张是APC和PerCP，第二张是APC和PerCP-Cy5.5.仪器的配置都是有蓝激光和红激光，紫激光。您指的配置是指的这4个指标检测通道的滤光片信息吗