圈门要全部样本都一致嘛？

zdvfsadb · 发表于 2024-1-12 19:02:21

想请教各位老师一个问题，我的7个批次的实验时间跨度大概是2个月，三组共用的是同一套template，现在实验做完准备一起分析的时候，所有的样本需要共用完全一样的圈门策略吗？比如在Flowjo里面直接拖拽圈门策略应用到所有样本。

这一批的实验是表面染色，第一次实验设置了FMO，但是因为群基本能分开（能分开但不是绝对的泾渭分明）所以后续没有做FMO了。

目前有一点顾虑的是，因为这边的机器每周会有一次维护，不太清楚这会不会对结果带来异质性，也不确定该不该每次分别圈还是共用完全一样的阳性阈值，麻烦各位老师给点建议，谢谢！

niwanmao · 发表于 2024-1-12 19:02:22

染色后分群如果清楚，按照分群位置可做微调

如果分群不清楚，还是建议每次试验时，均做一次FMO

zdvfsadb · 发表于 2024-1-15 01:55:13

niwanmao 发表于 2024-1-14 20:32
染色后分群如果清楚，按照分群位置可做微调

如果分群不清楚，还是建议每次试验时，均做一次FMO ...

谢谢倪老师，明白了

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