质谱流式数据分析问题

船长不好奇

质谱流式检测数据，下机fcs的events差异较大，手动清洗数据后living cells差异也大（有些差异2-3倍），如果只选择细胞量较大的样本，那么实验纳入患者数量减半，并且影响实验分组，这种情况下有没有好的分析建议？我目前查的资料还没找到外周血质谱流式分析细胞量的最低要求，请问有人了解吗?

另外，请问有没有什么好的质谱流式分析教程推荐？或者课程？

niwanmao

你是希望各个FCS的events一致吗？

可以downsample  events数高的FCS，使其与少的一致。 也可以不进行downsample，直接用

最低数据量的要求，主要是针对目的细胞而言，并非整体细胞量。例如你要检测Treg，那么你至少获取50~100个成群的Treg数量，那么这个FCS文件就算达标了

船长不好奇

niwanmao 发表于 2024-2-1 09:25
你是希望各个FCS的events一致吗？

可以downsample  events数高的FCS，使其与少的一致。 也可以不进行downs ...

好的，我明白了，感谢！