不同流式软件结果的差异

wmj123456 · 发表于 2024-2-2 14:15:46

请教下各位老师，最近做了肿瘤组织的实验，染色CD3/CD4/CD8。分别用Flowjo和仪器自带的软件分析了2个样本，发现CD3,CD4,CD8+的比例竟然差异10%左右。组织样本没有用percoll过滤，细胞成分比较杂，第一张淋巴细胞圈门两个软件的比例还是接近的，后面的亚群分群都比较明显，但是百分比有差异。请问该怎么办？以哪种软件分析的为准？还是从头到尾只用一种软件来分析。各位老师有遇见过这种情况吗？不同软件分析的差异有多大吗？

AAAAAjjj · 发表于 2024-2-2 14:25:32

我之前也有这种感觉，上机时候看的和flowjo分析的完全不一样。所以后面我的做法就是所有数据都统一使用flowjo分析，不看流式仪自带的软件的数据。

niwanmao · 发表于 2024-2-2 15:29:45

不应该啊，是否因为坐标轴的Scale模式不一样，导致部分信号被漏掉了？

wmj123456 · 发表于 2024-2-2 15:59:36

niwanmao 发表于 2024-2-2 15:29
不应该啊，是否因为坐标轴的Scale模式不一样，导致部分信号被漏掉了？

应该不是这个情况，第一张图是圈淋巴细胞的，比较靠右，两个软件都是看到了完整的一群。。。。。

niwanmao · 发表于 2024-2-2 16:08:26

wmj123456 发表于 2024-2-2 15:59
应该不是这个情况，第一张图是圈淋巴细胞的，比较靠右，两个软件都是看到了完整的一群。。。。。 ...

有图吗？这确实有点奇怪

范晋波 · 发表于 2024-2-2 16:23:38

不要怪软件，大概率是你不会分析

wmj123456 · 发表于 2024-2-2 21:34:56

niwanmao 发表于 2024-2-2 16:08
有图吗？这确实有点奇怪

倪老师，上传数据又有限制了啊，我的是120MB，不行

niwanmao · 发表于 2024-2-3 18:49:06

wmj123456 发表于 2024-2-2 21:34
倪老师，上传数据又有限制了啊，我的是120MB，不行

120兆是超限的
分批压缩看看

飞翔 · 发表于 2024-2-4 16:11:21

这个应该是你的问题，不是软件的，没看到你的具体结果

wmj123456 · 发表于 2024-2-18 10:55:29

本帖最后由 wmj123456 于 2024-2-18 11:27 编辑

niwanmao 发表于 2024-2-3 18:49
120兆是超限的
分批压缩看看

倪老师，我只有一个数据，没有分批压缩啊，目前还是上传不了，100MB，数据限制能增大到100吗

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