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[结构和原理] 一个多色panel,如何计算其complexity?

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发表于 2024-5-27 21:17:58 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星未解决
请教一下老师,对于一个多色panel,如何计算其complexity?

麻烦老师,告知一下计算方法,谢谢。

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发表于 2024-5-27 22:01:31 | 显示全部楼层
计算流式多色方案的复杂性需要考虑方案中使用的荧光素之间的光谱重叠或溢出。复杂性指数是一种指标,考虑了方案中所有荧光色素之间的累积光谱相似性,以评估整体光谱复杂性。

以下是计算多色面板复杂性的关键步骤:
1. 获取所用特定流式细胞仪的溢出扩散矩阵(SSM)。SSM 显示仪器检测到的每对荧光素之间的光谱重叠程度[1][3]。
2. 使用 SSM 中的值计算每对荧光素的相似性指数。相似性指数范围从 0 到 1,1 表示 100%光谱重叠[3]。
3. 方案的总复杂度指数是方案中所有SSM之和。

总复杂度指数越高,说明荧光素之间的光谱重叠越多,这可能会导致扩增误差和分辨率下降。

但需要注意的是,复杂性指数并不是一个绝对的标准,而是一个相对的指标,用于比较分析方案的设计。仪器上荧光检测器的数量等因素也会影响复杂性得分。[3]
FluoroFinder 等平台可以提供计算工具,帮助在方案设计和优化过程中计算这些指数。


引用:
[1] https://www.sciencedirect.com/sc ... i/S0003269721001111
[2] https://www.sigmaaldrich.com/US/ ... flow-cytometry-tips
[3] https://fluorofinder.com/spillover-complexity-index/
[4] https://www.bdbiosciences.com/en ... olor-flow-cytometry
[5] https://flow-cytometry.net/what-is-a-flow-cytometry-panel/


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