讨论：细胞周期分析拟合

niwanmao · 发表于 2011-11-14 13:43:29

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目前看到的拟合模型有两种：
1、watson（pragmatic）模型：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/3803091
2、dean-jet-fox模型：这篇文章未找到。

modfit好用，但我至今不知道它采用什么模型，也未看到相关资料。

haven_t · 发表于 2011-11-14 22:50:42

mulitcycal 没找到手动分析的选项，但提供了几个模型的结果供选择。

niwanmao · 发表于 2011-11-15 08:55:18

haven_t 发表于 2011-11-14 22:50

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mulitcycal 没找到手动分析的选项，但提供了几个模型的结果供选择。

multicycle里面显示了几种模型？

haven_t · 发表于 2011-11-15 23:09:45

下面应该就是用不同模型分析出来的结果，模型应该都是基于某些假设，一共有6个。有空我找下你提供那篇文章学习一下。

niwanmao · 发表于 2011-11-16 11:02:01

haven_t 发表于 2011-11-15 23:09

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下面应该就是用不同模型分析出来的结果，模型应该都是基于某些假设，一共有6个。有空我找下你提供那篇文章 ...

目前似乎在商业软件中就提到了watson（pragmatic）模型和dean-jet-fox模型这两种，说明应该不会有6种这么多。象multicycle这里所谓的多个model，我从图片上看，感觉应该不是不同的模型拟合，而是只使用了一种模型，只不过在计算数值时使用不同的方法（例如CVs fixed表明在拟合是，以固定的CV进行，模型还是原来那个；+Aggregates，可能是不是意思说在拟合时，进行了粘连体的排除或怎么的）。

haven_t · 发表于 2011-11-16 11:31:38

本帖最后由 haven_t 于 2011-11-16 11:32 编辑

图片每次只能显示一个，其实有六张。

niwanmao · 发表于 2011-11-16 12:11:49

haven_t 发表于 2011-11-16 11:31

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图片每次只能显示一个，其实有六张。

里面好像具体的模型名称它都不显示出来，是吧？

haven_t · 发表于 2011-11-16 13:44:54

是的。我可以把软件传给你，你试用一下。

haven_t · 发表于 2011-11-26 22:06:38

本帖最后由 haven_t 于 2011-11-26 22:06 编辑

细胞周期分析重要知识(源自MultiCycle).rar (249.45 KB, 下载次数: 75)
周期的基本原理，也是数学模型的基础

niwanmao · 发表于 2011-11-28 08:42:52

haven_t 发表于 2011-11-26 22:06

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周期的基本原理，也是数学模型的基础

说的很清楚。那就等待你在程序中实现了，很多站友都等着呢

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