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[细胞周期] 鼻咽癌细胞周期分析一例

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发表于 2012-10-26 09:44:22 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
本帖最后由 wmingzhen 于 2012-10-26 09:45 编辑

前段时间做了一次关于鼻咽癌的细胞周期分析。分4组:空白组,药物组,放疗组,放疗+药物组。

倪老师,如果有空的话,帮我看看数据分析有什么不妥之处。我的结果全部是使用Modifit软件的自动分析功能所得。
我比较困惑的是关于凋亡峰的问题,尤其是放疗组的凋亡峰和M1峰叠在一起,Fit后就是我上传图片的结果,不知这样合适吗?


fangliao.jpg

放疗+药物组

放疗+药物组

空白组

空白组

药物组

药物组

20121018.rar

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我分析出来是这样的,我觉得debris峰尽量往左移,因为从你的图上看的出debris应该很少,apoptosis峰应该是靠近G1峰的。假设你单纯化疗组的那个峰都的凋亡峰的话,那不是G1峰一点都没了,这个可能性很小,所以我还是认为那个峰是G1峰,可以对G1峰的位置进行微调,调到那个位置,另外可以从RCS值看出来,我把化疗组的峰设为G1,其RCS值只有1.多,而如果把它设置为凋亡峰,RCS值就3.多,一般RCS值越接近1 就越好。 见图: ...
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发表于 2012-10-26 09:44:23 | 显示全部楼层
我分析出来是这样的,我觉得debris峰尽量往左移,因为从你的图上看的出debris应该很少,apoptosis峰应该是靠近G1峰的。假设你单纯化疗组的那个峰都的凋亡峰的话,那不是G1峰一点都没了,这个可能性很小,所以我还是认为那个峰是G1峰,可以对G1峰的位置进行微调,调到那个位置,另外可以从RCS值看出来,我把化疗组的峰设为G1,其RCS值只有1.多,而如果把它设置为凋亡峰,RCS值就3.多,一般RCS值越接近1 就越好。

见图:
rpt_kongbai.png

放疗组

放疗组
rpt_yaowu.png rpt_fangliao yaowu.png
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 楼主| 发表于 2012-10-26 12:54:00 | 显示全部楼层
谢谢倪老师。但我还有些疑问。那就是,如果采用手动模式,就有很多人为因素在里面,同样的数据不同的人分析,结果会不一样。或者,同样的实验,重复三次,每次手动调节,每次肯定有差异,这种差异可以不用考虑吗?
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发表于 2012-10-26 13:10:57 | 显示全部楼层

MODFIT不同于我们在分析软件上拖动门,它只是在大致范围上由人确定,确定完一定的参数之后,它会根据这些设置进行自动拟合,这种拟合有它一定的数学模型依据在那里,会自动判断一些边缘,一般参数的些许变化不太会影响很大。你可以试试分析时把G1或G2的中轴往左或往右拖动一点点的距离(尽量靠近峰尖,不要超出峰的边缘),拟合后的结果都差不多的。
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 楼主| 发表于 2012-10-26 13:15:55 | 显示全部楼层
谢谢倪老师,学习了。
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