流式参数选择求助

赖浩强 · 发表于 2012-10-26 16:37:26

各位老师好，小生有几个流式数据分析的问题想请教给位达人老师。我做出的流式数据用Modfit分析时遇到如下问题：
1）文件打开后不知道选哪个，如图1、2
2）选择后设置的第一个门参数选择选哪个？如图3
3）第二个门参数选择，也不知道选择哪个。如图4
附：这个数据是用贝克曼流式细胞仪做出来的，希望能够得到给位老师指点！

niwanmao · 发表于 2012-10-26 21:10:41

1、建议把文件后缀名显示出来，这样可以方便知道文件类型。从图标看你有些同名文件是图片。
2、第二个参数应该选择FL2-W，你这里没有，难道跟库尔特机器有关？
3、正常情况下应该是第一个门在FSC/SSC点图上设，第二个门在FL2W/FL2A点图上设

相关链接:http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-243-1-1.html

赖浩强 · 发表于 2012-10-27 10:16:06

对的，有些确实是图片，源文件后缀名是.LMD格式来着。这样子的话该选择怎么样的参数呢？

niwanmao · 发表于 2012-10-27 11:06:06

赖浩强发表于 2012-10-27 10:16

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对的，有些确实是图片，源文件后缀名是.LMD格式来着。这样子的话该选择怎么样的参数呢？ ...

你们用的是什么机器？是没有选上area和height两个参数呢还是本来就没有？

赖浩强 · 发表于 2012-10-27 17:18:22

我想问的是，是不是只有.FCS格式的文件才能在Modfit里面打开呢？打开.LMD格式文件时首先弹出的是这样一个界面如图5，档随便选择一个参数进去之后就会出现这样一个界面，如图6，最后就是设门，但是设门就是没有FSC-SSC,跟FL2W-FL2A选择。不知道如何去解决，所以想请教老师！

赖浩强 · 发表于 2012-10-27 17:21:09

还有就是我也不清楚机器的型号是什么，只知道是用BECKMAN COULTER跑的流式。

niwanmao · 发表于 2012-10-27 19:30:17

赖浩强发表于 2012-10-27 17:18

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我想问的是，是不是只有.FCS格式的文件才能在Modfit里面打开呢？打开.LMD格式文件时首先弹出的是这样一个界 ...

lmd文件实质上也应该是FCS文件，只是可能coulter公司在文件格式上做了一点定制 @haven_t

主要是你获取的数据里面，这些标记怎么都没有FL2的，有点奇怪，能不能传个上来看看？获取的时候有没有取对？

赖浩强 · 发表于 2012-10-27 21:23:44

可以啊~这个是源文件

haven_t · 发表于 2012-10-27 23:08:56

niwanmao 发表于 2012-10-27 19:30

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lmd文件实质上也应该是FCS文件，只是可能coulter公司在文件格式上做了一点定制 @haven_t

主要是你获取 ...

coulter去粘连体的方法是不一样的。

niwanmao · 发表于 2012-10-27 23:09:39

赖浩强发表于 2012-10-27 21:23

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可以啊~这个是源文件

看了下你的数据文件，可以看出仪器是cytomics fc500，用来区分粘连体的信号是FL3 AUX。

数据文件信息

然后看一下该仪器的操作手册（见手册第28页：http://www.flowcyto.cn/bbs/reader.php?mod=flowreader&file=yEWWkhxoKzRXue5s6KLmCRshwKBgqIbXH16vtMWc），可以知道，该仪器是使用FL3的AUX作为鉴别粘连体的，这样，我们就清楚了应该选择LMD打开时的第一个FCS：

选择的FCS

在MODFIT弹出的要求设两个门的时候，分别选择FSC/SSC和AUXFL2LOG/FL3LIN两个点图（我看你们原始数据关键词信息里面AUX设置的是FL3，而这里AUX显示的是AUXFL2，可能是个显示错误，不用理它），最终分析结果如下：

分析结果

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