Smmc-7721细胞周期分析一例

wmingzhen

倪老师，您好。我这有两个数据再麻烦您帮我分析一下。周期分析是以RCS越接近1越好为标准进行分析吗？我这次结果自动分析接近1，而手动分析比自动分析的值大，而且同样的数据每次手动分析的结果RCS值都不一样，那最终结果选择RCS接近1的吗？
原始数据及我分析的结果请见下。

niwanmao

我分析的2号和4号标本分别如下面这样：

2号标本

可以看出，2号标本的RCS甚至还不如你前面自动和手动的。我个人认为：RCS是曲线拟合是否正确的一个指标，但是在现实中，我们还是应该与真实标本结合起来考虑，因为我们在获取标本的时候，有时候G2/G1往往做不到刚好2.0，所以我们在拟合时需要不断调整G2/G1的比例，直至峰的拟合比较符合真实情况，同时RCS尽可能小于3接近1。自动拟合虽然看到RCS它能够做到很小，但是这个峰的位置明显与我们真实标本不符，所以还是不能信，机器毕竟是机器，比不上人聪明。

wmingzhen

谢谢，倪老师。看来，细胞周期分析还真得靠经验了。
在拟合时，怎么不断调整G2/G1 的比例呢？通过调整G1峰或G2峰的位置来实现吗？
又怎么判断峰的拟合与实际情况符不符合？

niwanmao

wmingzhen 发表于 2012-11-1 13:03

                               
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谢谢，倪老师。看来，细胞周期分析还真得靠经验了。
在拟合时，怎么不断调整G2/G1 的比例呢？通过调整G1峰 ...

我看你用的是3.2版本的MODFIT，不知道在设置里面有没有G2/G1的比例设置？就是点击工具栏上“Choose Model”后弹出的对话框中设置Linearity，设置值可从1.5－2.5之间，你按照自己标本的G2峰和G1峰的大致位置进行估计。

判断是否拟合的正确，得靠肉眼了，靠你对你自己标本的了解，其实在多数情况下，RCS还是可靠的。

wmingzhen

谢谢倪老师。我用的是3.2版本的MODFIT，我找到Linearity的设置了。