请问至少收集多少细胞就可以了？

FCS

我现在跑流式，一般收集1万个细胞，像细胞周期、双染凋亡等，但经常遇到细胞密度没有6次方，甚至没有5次方，
或者处理组本来密度就低，这时候，如果还要记录1万，那要跑10几分钟，很烦人啊！
请问至少收集多少细胞就可以了，可以进行统计学分析了？

niwanmao

AV-PI凋亡的话，可能5000个问题也不是很大吧，因为比例都不低，都还可以的。
细胞周期的话，MODFIT模型拟合诊断中提示有效细胞要在2万个以上，好象是这样，你打开MODFIT看看。
其它实验也是看你分析需要，例如我们免疫分型多数情况下取1万个，但也可以为了增加灵敏性，将总数取到10万个。一般残留病灶检测至少取10万个，也可以取20、30、50万都行。

FCS

"细胞周期的话，MODFIT模型拟合诊断中提示有效细胞要在2万个以上，好象是这样，你打开MODFIT看看。"
倪老师，我的modift提示1万就可以了

FCS

"也可以取20、30、50万都行。"
哇！！那不是要跑半天！！
可能临床要求高吧，我是跑科研的。

niwanmao

FCS 发表于 2013-3-16 16:44

                               
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"细胞周期的话，MODFIT模型拟合诊断中提示有效细胞要在2万个以上，好象是这样，你打开MODFIT看看。"
倪老师 ...

嗯，那是我记错了，但是有效细胞要达到1万个（不包括碎片和粘连体），所以我觉得在获取时的总数最好设到2万个吧。

FCS

niwanmao 发表于 2013-3-16 16:51

                               
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嗯，那是我记错了，但是有效细胞要达到1万个（不包括碎片和粘连体），所以我觉得在获取时的总数最好设到2 ...

是啊，我现在就是这样设的，细胞不够的，就跑干为止，呵呵。
周期的细胞数比较明确，因为有软件像modfit可以diags
http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2140-1-1.html
但其他科研应用，需记录的细胞数，有时真的不好把握。

niwanmao

FCS 发表于 2013-3-16 17:10

                               
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是啊，我现在就是这样设的，细胞不够的，就跑干为止，呵呵。
周期的细胞数比较明确，因为有软件像modfit ...

1万是比较普遍的。如果目的细胞比例很低，例如只有0.0几％，那么就需要取到10万甚至50万。

FCS

今天读《临床流式细胞分析》，刚好看到这方面的分析，与大家分享一下。

FCS

“目的细胞一般不应<2000个”，就是至少要2000个才有统计学意义，这样理解对吗？

niwanmao

FCS 发表于 2013-4-3 10:44

                               
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“目的细胞一般不应

我觉得这本书上更多的是一些经验性的东西，常见的东西，它这个2000个可能是按照10000个总数的20％计算的，因为以前的某抗原表达阳性是按照20％的阳性率作为标准的。假如我们做脑脊液，细胞一共也没几个，有时候总数能取到1000个算不错了，这时如果都是白血病细胞，也是可以分析的。