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[细胞周期] 周期分析,这样做对吗?

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发表于 2013-3-17 09:46:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏1流星已解决
本帖最后由 cccssszzz08 于 2013-3-17 09:48 编辑

这两天做了一下细胞周期,本来实验进行的都比较顺利。但是在结果分析的时候却遇到了问题。要是选择自动分析的话,就出现了四倍体。选择手动分析的话,G2期却拟合不出来。(BDcalibur, Modfit)
周期结果的图片如下:

control

control

positive

positive

sample

sample

还有一个问题就是RCS值太高了,是由于什么原因导致的呢?该怎样避免?
另外附上数据 mfl怎么上传啊?


最佳答案

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二倍体和四倍体之间是成1:2的关系,G2/M期和G0/G1期的DNA含量也是2:1关系,但是关键是我们获取时由于电压不同,肯定会跟2:1有些差异,所以可以在1.5-2.5:1之间微调,使拟合结果符合实际结果和我们的期望。
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发表于 2013-3-17 09:46:46 | 显示全部楼层

二倍体和四倍体之间是成1:2的关系,G2/M期和G0/G1期的DNA含量也是2:1关系,但是关键是我们获取时由于电压不同,肯定会跟2:1有些差异,所以可以在1.5-2.5:1之间微调,使拟合结果符合实际结果和我们的期望。
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发表于 2013-3-17 10:03:19 | 显示全部楼层
你这些标本应该都是二倍体吧?那么就手动分析,调整G0/G1和G2/M峰的位置,从图形拟合结果看,你可能问题出在G2/M峰的位置没放置好。如果上传,建议上传你获取的流式数据文件,不要上传mfl文件,mfl文件只是modfit的一个配置文件。
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 楼主| 发表于 2013-3-17 17:40:51 来自手机 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-03-17 10:03:19
你这些标本应该都是二倍体吧?那么就手动分析,调整G0/G1和G2/M峰的位置,从图形拟合结果看,你可能问题出

我手动分析的时候把G2/M期放对了位置,可是还是不行么!我回去上传文件,您看看吧!
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发表于 2013-3-17 17:46:48 | 显示全部楼层
cccssszzz08 发表于 2013-3-17 17:40
我手动分析的时候把G2/M期放对了位置,可是还是不行么!我回去上传文件,您看看吧! ...

哦,对,新版本需要不断调节设置中的G2/G1 ratio,直至模型拟合符合峰的分布,并且各诊断参数都在预期范围内。
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 楼主| 发表于 2013-3-17 18:52:06 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-3-17 17:46
哦,对,新版本需要不断调节设置中的G2/G1 ratio,直至模型拟合符合峰的分布,并且各诊断参数都在预期范 ...

打包的附件就是我的结果,请倪老师帮忙看看。

Hela.zip

465.58 KB, 下载次数: 3

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发表于 2013-3-17 20:40:04 | 显示全部楼层
cccssszzz08 发表于 2013-3-17 18:52
打包的附件就是我的结果,请倪老师帮忙看看。

我尝试了几次,发现G2/G1为1.86-1.88之间的数值比较适合,就拟合的比较好。
下图是1.86时的拟合结果。

1.86

1.86
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 楼主| 发表于 2013-3-17 23:53:56 来自手机 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2013-03-17 20:40:04


我尝试了几次,发现G2/G1为1.86-1.88之间的数值比较适合,就拟合的比较好。
下图是1.86时的拟合结果。
[

哦,我知道啦!谢谢倪老师。又学会一招。原来手动分析的时候不是必须2倍关系呀!<br />
可是为什么二倍体和四倍体不成1比2呢?
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