流式分析助手－跨平台版仿CellQuest

niwanmao

流式分析助手是流式中文网为方便国内用户，基于FCSalyzer汉化并增加部分快捷键等功能制作而成，版权归Sven Mostböck。

流式分析助手完全免费，单个文件，下载即可使用，你可放在优盘中随身携带（windows系统需具备JAVA虚拟机运行环境）。
然而目前的功能比较局限，只能分析FCS 2.0格式的数据，只有点图和直方图两种可供选择，设门也只有十字门和多边形门两种，目的只是供朋友们应急用。操作方式与cellquest类似。

常用分析操作指南：
新建分析模板（快捷键Ctrl+N）或打开已有的分析模板（快捷键Ctrl+O），选择您要画的图形（点图或直方图），进行设门等操作，最后点击“分析数据”菜单下的“统计结果”（快捷键Alt+S）命令，即可显示各类细胞百分比。
在分析时，您可以使用快捷键Ctrl+A全选所有图形，再用Ctrl＋右箭头切换至下一个文件，或用Ctrl＋左箭头切换至上一个文件，或用Ctrl＋Q在当前选择的图形上导入新的数据分析。这些快捷操作均类似于经典的CellQuest。

运行环境提示：
如果双击该文件无法运行或提示出错，可能您的WINDOWS或MAC、Linux系统未安装JAVA运行环境（JRE），请从下列地址下载：
https://www.java.com/zh_CN/download/

软件界面预览和简介

软件界面预览和简介

软件下载（免流星）： flowcytoAnalyst.jar (421.88 KB, 下载次数: 638)

2013-3-25 10:30 上传

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niwanmao

archerliang 发表于 2020-11-23 11:34
倪老师，刚才下载了FCSalyzer，但是没法打开我的fcs文件是怎么回事？flowjo v10能打开，但是不太会用 ...

需要先用New Document建新窗口，然后在画个散点图，此时会跳出窗口让你选择文件。
接着，就可以用Ctrl+左、右方括号，前后切换文件。

niwanmao

samuro 发表于 2018-4-29 23:43
又有新版本了。
http://sourceforge.net/projects/fcsalyzer

我跟踪着，3月前发布的，变化不太大，里面的补偿调节还是不太好用，所以就没有再汉化。

niwanmao

2017年2月21日
FCSAlyzer作者最近几天发布了新版0.9.13 alpha，FCS2.0和FCS3.0都支持了，并且增加了密度图和图形叠加功能、增加了Logicle（双指数）显示和调节功能，而且可以调节补偿。
于是流式中文网马上以最快的时间进行了汉化。新版本汉化、编译后大小不足400KB，操作上和CellQuest如出一辙，尽管功能上不如商业化软件方便，但该有的功能都有了，关键是免费、小巧、无需安装、跨平台（Win、Mac、Linux均可用）。
运行环境提示：
如果双击该文件无法运行或提示出错，可能您的WINDOWS或MAC、Linux系统未安装JAVA运行环境（JRE），请从下列地址下载：
https://www.java.com/zh_CN/download/

屏幕截图：


软件下载：
flowcytoAnalystV0.9.13.jar (382.69 KB, 下载次数: 397)

2017-2-21 20:45 上传

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dragonhzqsmmu

好像现在更新到更新的版本了

niwanmao

haven_t 发表于 2013-3-25 20:14

                               
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简单易用，继承了Cell quest的特点，无论从数据组织还是门的组织都是和Cell quest一脉相承的，甚至可以说是 ...

从名字中找到作者信息了，是Institute of Immunology, University of Regensburg, Regensburg, Germany的，文章发了很多，真是全才。
是不是老外学编程容易些啊？太不平等了

joushua.L

支持一下！

haven_t

既然是Java的程序，倪兄可以可以和他交流一下，做个在线分析系统。

niwanmao

haven_t 发表于 2013-3-25 12:03

                               
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既然是Java的程序，倪兄可以可以和他交流一下，做个在线分析系统。

暂时先看看再说。

haven_t

简单易用，继承了Cell quest的特点，无论从数据组织还是门的组织都是和Cell quest一脉相承的，甚至可以说是Cell Quest完美移植到其他平台，使用Cell quest的用户无需学习立即可以上手。基本可以说是无可挑剔，若真要挑点毛病的话就是没有惊喜，作者是哪里人啊？

niwanmao

haven_t 发表于 2013-3-25 20:14

                               
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简单易用，继承了Cell quest的特点，无论从数据组织还是门的组织都是和Cell quest一脉相承的，甚至可以说是 ...

不知道呢。只看到名字。
给作者写了封信，询问是否可以加入FCS3.0读取功能，作者的回信还是挺有令人振奋的（先解决bug，然后增加密度图、图形叠加功能，最后加入FCS3.0读取功能、LOG转换和离线补偿）：

I am currently taking care of various bugs. I have also
started to include density plots. The overlays come next.
Once overlays are completed and the program is usable
without too many horrible bugs, I plan to to include FCS3
data files.

Unfortunately FCS3 requires a lot more than just displaying
the events. For proper usage of FCS3 files, I will need to
include logarithmic data transformations and of course
compensation. These two things won\'t be easy to do so it
will take some time.

cccssszzz08

niwanmao 发表于 2013-03-25 20:52:31

                               
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从名字中找到作者信息了，是Institute of Immunology, University of Regensburg, Regensburg, Germany的

顶起！

niwanmao

dragonhzqsmmu 发表于 2013-6-15 10:00

                               
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好像现在更新到更新的版本了

是的，前些天看到作者更新了，但只增加了密度图，其它改动不大，就没汉化。
我们当初汉化时加了不少类似于cellqeust的快捷键，作者依然没加上。