到底取哪个中位数来判断MFI强弱

有中有为

这里的中位数median有两个，一个是所取总细胞的中位数104.62，还一个是R7门之后的中位数323.54. 我想问下我要判断MFI的强弱到底是用哪个median.

niwanmao

你没搞清楚概念，请参见：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2189-1-1.html

有中有为

niwanmao 发表于 2013-8-29 23:57

                               
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我这个是在LOg状态下呀，想要MFI不是用中位数嘛？麻烦了

有中有为

niwanmao 发表于 2013-8-29 23:57

                               
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我这个是在LOg状态下呀，想要MFI不是用中位数嘛？麻烦了

有中有为

niwanmao 发表于 2013-8-29 23:57

                               
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不是说在LOG状态下，非正态分布时，取中位数来判断MFI是比较好的一个指标嘛

niwanmao

有中有为 发表于 2013-8-30 00:12

                               
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不是说在LOG状态下，非正态分布时，取中位数来判断MFI是比较好的一个指标嘛 ...

应该这么理解：当你要分析的峰呈正态分布时，log坐标，此时geomean和median基本重叠，可以用任何一个，当然我个人觉得geomean更好；当你要分析的峰呈非正态分布时，log坐标，此时建议用median。
从你的图上看，你的R7为什么不设在下图中的红色箭头处呢？如果设在红色箭头处，阳性峰应该基本上正态分布，可以用geomean，也可以用median，两者数值比较接近。

有中有为

niwanmao 发表于 2013-8-30 08:53

                               
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应该这么理解：当你要分析的峰呈正态分布时，log坐标，此时geomean和median基本重叠，可以用任何一个，当 ...

这个R7门是根据阴性对照设的，像比较平行组之间的MFI是不是不要用这个R7门，而直接用R1所做出来的104.62

niwanmao

有中有为 发表于 2013-8-30 09:33

                               
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这个R7门是根据阴性对照设的，像比较平行组之间的MFI是不是不要用这个R7门，而直接用R1所做出来的104.62 ...

是阴性对照还是同型对照？

有中有为

niwanmao 发表于 2013-8-30 09:36

                               
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是阴性对照还是同型对照？

阴性对照，是没有用流式抗体的，直接用PBS做的

有中有为

有中有为 发表于 2013-8-30 09:50

                               
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阴性对照，是没有用流式抗体的，直接用PBS做的

设这个R7门之前是想比较阳性率，但是结果出的大部分是95%以上，所以我现在想用中位数来进行MFI比较，那中位数比较是不是就不用这个R7门了，直接比较各平行组中位数就可以了，麻烦老师了