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细胞超声裂解后用流式细胞术定量检测自噬

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发表于 2014-8-14 21:41:35 | 显示全部楼层 |阅读模式

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自噬是一种细胞蛋白和细胞器在溶酶体中降解的动态过程。目前检测自噬的方法包括显微镜下计数细胞内自噬囊泡(AVS)的数量。
在本文中,作者发明了一种叫OFACS(细胞超声处理后的细胞器流式检测)方法,使细胞经过快速超声裂解后,形成均匀的细胞匀浆,但自噬囊泡仍能保持其荧光标记(经光镜、电镜鉴定AV囊泡保持完整)。
具体步骤如下:
  • 细胞用含10%FBS的RPMI-1640培养,并经药物处理,加入AO染料。
  • 细胞用3×1s的频率进行超声裂解,湿度75%。也可以用28 G 1/2的胰岛素针头反复抽吸细胞,可产生类似的效果,不过超声裂解更简单、更可靠、重复性更好。
  • 细胞匀浆在室温或4℃下上机。


分析时,首先通过FSC/SSC圈出亚细胞群体(见图1),然后特异的自噬囊泡可通过特定的荧光通道圈出(图2),并与对应的细胞数量、微球进行校准计数。

图1

图1


图1

图2

图2


图2


该方法已在以下细胞株中验证通过: PC3, LNCaP, HEK293, U87, MEF, 537MEL, BT474, SKBR3, ZR-75, MCF7, SKMEL23, MALME3, MALME3M and HME (American Type Culture Collection).



PLoS One. 2014 Jan 29;9(1):e87707.
Novel quantitative autophagy analysis by organelle flow cytometry after cell sonication.

Degtyarev M(1), Reichelt M(2), Lin K(1).

Author information:
(1)Department of Translational Oncology, Genentech, South San Francisco, California, United States of America.
(2)Department of Pathology, Genentech, South San Francisco, California, United States of America.

全文:http://www.plosone.org/article/i ... ournal.pone.0087707

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