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2014年已经过去,流式细胞术领域也陆陆续续出现了一些新生事物,有些您可能已经尝试过,有些您可以了解过,那么,2015年,其中有哪些值得我们继续期待,有哪些新的仪器、试剂和软件会继续带给我们惊喜呢?
一、仪器
流式细胞仪的发展方向各有不同:
一个方向是越来越小、越紧凑、越强大,适应高端研究用户需求;
一个方向是越来越易用,以使得流式细胞仪更容易被所有研究者所接受。
在2015年,分析型流式细胞仪,有以下几款机器值得我们关注:
1、BD Fortessa X50。这款仪器在Cyto2014会议上报道过,可检测20种以上荧光参数。这种趋势使得我们有可能实现质谱细胞术那种级别的多参数检测。如果这项技术能够扩展到细胞分选,那么就可能使我们非常方便和精确地分选复杂的亚群。
2、Life Tehnologies的Attune NxT。这款流式细胞仪采用声波聚焦,与传统流式的鞘液聚焦相比,其获取速度更快、CV值更小。Attune Nxt最多可获取14种荧光参数,仪器小巧而强大。
3、ACEA(艾森)发布的NovoCyte。Novocyte也是一款小仪器,但配置不低,最高可达3激光13色,并且有体积定量功能,能够实现无需定量微球直接进行绝对计数。
4、Beckman Coulter的CytoFLEX。这款仪器最初由苏州赛景发明,后被Beckman收购。CytoFLEX有第二根405nm激光收购第二个SSC,从而在微颗粒的区分上更具优势,而且仪器采用了APD(Avalanche Photo Diode,雪崩光电二极管),而不是传统的PMT(光电倍增管)。
分选型流式细胞仪历来被认为是大而复杂的,不过以下几款分选仪给了我们不一样的新面貌:
1、Propel Avalon(现在叫Bio-Rad S3细胞分选仪)。仪器小巧并且易于使用。
2、Cytonome的Viva。单色桌面型分选仪,10万美元以下,适合分选GFP转染的细胞。
3、Miltenyi-Biotech的Tyto。基于微液流、分选盒可更换的新型流式分选仪,体积小巧,比较适合空间小的实验室,并且分选仪不使用电荷分选,可减少生物气溶胶的产生,避免生物危害。因为系统是低压、序贯分选,故一次只能分选一个群体。
二、试剂
荧光纳米晶体对于流式专业人员来说,有利有弊。从晶体大小来说,很难找到好的化学方法将其与生物标记物连接起来,但是偏偏这种晶体可以极大的扩展流式检测参数数量。这些年来,只有少数几个厂家可以生产。QuantaCyte的Trilite纳米晶体是纳米晶体市场上一种有意思的新事物,非常期待这种新染料与传统的Qdot、eFluor纳米晶体染料相比性能如何。
Sirigen研发的Brilliant Violet染料,市场上主要是Biolegend和Beckton-Dickenson两家在卖,目前来说还是十分不错的选择,其亮度更高、不存在纳米晶体的结合问题,并且扩大了荧光染料选择范围。随着荧光素进一步扩展到“Brilliant Ultraviolet”,流式专业人员有必要选择配有紫外激光的流式细胞仪了,在2015年,真正的18色流式细胞仪也会有可能逐渐进入市场。
流式细胞术另一个值得关注的领域就是RNA水平的检测。目前这方面有多家公司在开展,努力使mRNA水平的表型检测成为可能。 eBioscience的PrimeFlow RNA detection system和Advanced Cell Diagnostics RNAScope均值得密切关注。
三、软件
流式细胞术中最为繁琐和累人的就是方案设计:搜索抗体数据库、确定可用的抗原/荧光素组合、根据仪器选择。Fluorish 2.0是一个很强大的工具,可以帮助你设计流式方案,并且保存。Fluorofinder也是一个搜索和组合抗体的在线工具。这两个软件均对流式专业人员十分重要。
数据分析软件的改进和更新也值得关注,有些软件是由于PC操作系统的改变而改变,例如Beckman-Dickenson的DIVA 8。FlowJo则为了大数据的复杂分析而设计了很多功能。
Cytobank的最近版本,整合了viSNE和散点图的逐通道着色功能,均是对这个免费软件系统的一些引人注目的新式分析工具。对于CyTOF分析,Cytobank和SPADE平台仍然是质谱细胞术数据的主要工具。
DeNovo团队亦在继续努力开发FCS Express 5。从该版本软件的beta版测试用户反馈来看,此版本集成了统计学分析功能,这使得研究者可以无缝进行分析和统计学处理。
最后,Inivai开发的Flow Logic也是一个很不错的软件,在界面上与FlowJo类似。
结语:
竞争引发创新,对于终端用户是好处,可以给用户带来更快、更便宜、更易用的仪器、软件。我们期待2015年是美好的一年、创新的一年。
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