流式进阶小技巧

小憨 · 发表于 2015-9-1 21:26:24

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最近做了一批多色的流式分析，一共26个样品，10组指标，一组指标最多6染，用最新的flowjo 10分析了半个月，然后崩溃的写下了如下文字：

千万千万好好调电压，不要用类似贝克曼baseline off-set的功能，也不要指望双指数转换，转完了细胞群跟刀切的似的，巨丑！
调电压最好用同型调，别用阴性，细胞会右移！会右移！会右移！；样品上机前好好洗几遍别偷懒，不好好洗细胞会右移！会右移！会右移！（重要的事情说三遍），等测完了细胞全贴右边以后你就哭吧。
做稀有细胞的时候千万记得调阈值！调阈值！调阈值！不要收垃圾碎片占地方；不用的通道勾掉！不用的通道勾掉！不用的通道勾掉！多余的信息不要采集，否则你就等着租一台工作站来分析你那好几G的数据吧，或者买一台32G内存的电脑。当你一遍一遍死机重启的时候你就会相信我说的话了……

十二郎 · 发表于 2015-9-2 21:59:41

请问憨哥你说的贝克曼的baseline off-set的功能是什么意思？能大致解释一下吗？？谢谢

niwanmao · 发表于 2015-9-2 22:14:49

十二郎发表于 2015-9-2 21:59
请问憨哥你说的贝克曼的baseline off-set的功能是什么意思？能大致解释一下吗？？谢谢 ...

贝克曼的baseline off-set类似于自动的logicle转换，将负值的数据统统显示出来，所以不会出现压轴的信号。

十二郎 · 发表于 2015-9-3 08:12:48

niwanmao 发表于 2015-9-2 22:14
贝克曼的baseline off-set类似于自动的logicle转换，将负值的数据统统显示出来，所以不会出现压轴的信号 ...

明白了谢谢

小憨 · 发表于 2015-9-3 11:41:59

十二郎发表于 2015-9-3 08:12
明白了谢谢

楼上正解

渡口小康仔 · 发表于 2015-9-6 22:15:31

niwanmao 发表于 2015-9-2 22:14
贝克曼的baseline off-set类似于自动的logicle转换，将负值的数据统统显示出来，所以不会出现压轴的信号 ...

老师，这是不是和Canto上的负轴显示一个用途的，那个也有这种影响吗？

小憨 · 发表于 2015-9-7 08:19:38

渡口小康仔发表于 2015-9-6 22:15
老师，这是不是和Canto上的负轴显示一个用途的，那个也有这种影响吗？

对，一个道理。
如果你采集数据和分析数据都用一种软件，比如BD的diva，那就不用担心；但如果采集数据和分析数据不是同一种软件的话，有可能兼容性不是太理想，数据算法不太一致，最终导致“失真”。比如我采集是用贝克曼的Gallios，他的操作软件好像叫cxp，里面有个叫base line off-set的功能，类似你说的负轴显示功能，采集的数据是lmd格式的，也不是主流的fcs格式，导致我后续用第三方软件分析就遇到好多困难，主要是补偿不好调整。

渡口小康仔 · 发表于 2015-9-10 20:15:18

小憨发表于 2015-9-7 08:19
对，一个道理。
如果你采集数据和分析数据都用一种软件，比如BD的diva，那就不用担心；但如果采集数据和 ...

谢谢老师指点~

小憨 · 发表于 2015-9-10 20:39:25

渡口小康仔发表于 2015-9-10 20:15
谢谢老师指点~

不敢当不敢当，还达不到老师的级别，大家一起交流切磋，我喜欢分享的感觉~

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