周期Modfit拟合时，对照组测试组的G2/G1值是不是要一样

viviwzw · 发表于 2015-11-6 14:45:11

请问倪老师，在周期拟合时，同种细胞的对照组测试组的G2/G1值是不是要保持一样，还是以每张图的CV值跟RCS值调到最合适为准？另外一个问题，把细胞的促癌基因敲掉了，是不是应该分裂减缓，是这样的关系吗？实际做出来的结果是分裂加速，怎么解释这个结果？

viviwzw · 发表于 2015-11-9 10:30:40

求解答{:soso_e154:}

niwanmao · 发表于 2015-11-9 12:18:10

如果是同一管细胞做出来的，实验结果（不单单G2/G1，其它比例方面）应该非常接近才对，如果相差过大，需要检查仪器、处理步骤等原因。

至于拟合方面，首先看RCS，其次看CV。

至于促癌基因敲除，是否应该分裂减缓还是加速，应该以实验结果为准，而不是自己推测这样就应该这样，因为癌症的发生并不是一个基因决定的，而是众多基因协同，甚至体内环境其它因素也会影响，如果你重复三次出来都是这样的现象，你就应该认同实验结果，推翻自己原来的设想，转而研究为什么会这样。

viviwzw · 发表于 2015-11-9 16:37:27

是同种细胞分了两管，一管是不处理的对照组，另一管是加了药或者敲除掉的细胞，测周期来看敲除这个基因对细胞周期的影响，这样两管的结果在拟合时G2/G1值要一样吗？

niwanmao · 发表于 2015-11-9 20:20:18

viviwzw 发表于 2015-11-9 16:37
是同种细胞分了两管，一管是不处理的对照组，另一管是加了药或者敲除掉的细胞，测周期来看敲除这个基因对细 ...

G2/G1应该都是一样的，你这里只是因为基因的敲除，可能影响了细胞周期，所以或许会出现异倍体或者周期比例的改变。

viviwzw · 发表于 2015-11-11 08:53:54

好的，明白了，谢谢倪老师的解答

Veblen · 发表于 2023-7-19 16:26:47

niwanmao 发表于 2015-11-9 20:20
G2/G1应该都是一样的，你这里只是因为基因的敲除，可能影响了细胞周期，所以或许会出现异倍体或者周期比 ...

接着上面的问题，一般情况下G2/G1的值在多少之间是合适的呢？因为不可能绝对等于2

niwanmao · 发表于 2023-7-19 16:35:17

Veblen 发表于 2023-7-19 16:26
接着上面的问题，一般情况下G2/G1的值在多少之间是合适的呢？因为不可能绝对等于2 ...

Modfit上有范围，1.5至 2.5之间。

Veblen · 发表于 2023-7-19 22:12:07

niwanmao 发表于 2023-7-19 16:35
Modfit上有范围，1.5至 2.5之间。

好的，谢谢老师

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