做到这5点，你的流式图就能“无声胜有声”

niwanmao

先看下面这张图：

图

你觉得你能够重复出这个实验吗？如果你是编辑，会接受这样的图吗？

此时，可能很多FLOWER可能觉得，这图不是做得挺好的嘛，分群还不错，补偿也调节到位。这倒确实，但是有几点你可能没有注意，图中少了很多应该告诉其他人的信息，例如坐标刻度、坐标中荧光标记和滤光片的参数、门内细胞的比例等等。

因此，我们在平时进行流式细胞术的科学制图时需要注意以下五方面的要点，才能做出符合出版要求的图片：

1、将坐标轴刻度显示出来
这张图没有刻度，所以无法判断数据是LOG还是LIN的。尽管我们知道抗体的检测基本上都是用LOG坐标，但是没有刻度的图，会让人无法确定并且对其科学性产生怀疑。

2、荧光素
坐标轴除了标明所用的抗体，还应该标明荧光素，因为不同的荧光素有不同的信噪比和亮度（如PE和APC比FITC、PB要亮很多，可能会分群更好）。为了帮助其它科研工作者能够更好地重复出实验，除了实验方法部分说明之外，图上亦应该标上荧光素。

3、激光和带通滤光片
不同激光器可激发不同的荧光素，所用的滤光片也可能不同，使用不同的滤光片，可能会导致不同的荧光强度。例如PE在488nm激发效率比561nm高很多。为了帮助其它人能够重复出你的实验，应该标上激光器和荧光素检测用的滤光片，例如PE-cy5 780_60 561nm（依次为荧光素名称、带通滤光片的中值和带通范围、激光器激发波长），而不应该只标上FL1、FL2等。

4、门内有什么？
前面这个图中显示了不同的细胞群，但没有显示出每个群内的细胞数量。在图中，显示细胞比例或者门内细胞的MFI，很重要。

5、细胞总数
告诉读者你获取了多少细胞，对于理解和重复实验都非常有帮助，尤其是一些比例少的细胞，细胞总数关系到结果的准确性。可以考虑在文章的Supplementary Information中显示设门统计信息。


看了以下这几点，各位FLOWER，你们明白流式图应该怎么做了吗？预祝大家在实验中都能获得满意的数据并且做出高质量的图，发出高影响因子的文章。

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好文，支持下，再配一个按要求做好的图更好~

fdluzhufeng

学习了，特别是第3点，一般人都不太会注意。

weide12

文章中很少有注意这些的吧，PE在488比561强吗？怎么工程师建议PE放在561激发光下，难道只是为了减少补偿？

niwanmao

weide12 发表于 2015-11-12 19:14
文章中很少有注意这些的吧，PE在488比561强吗？怎么工程师建议PE放在561激发光下，难道只是为了减少补偿？ ...

不会吧。

weide12

PE应该是在561强，http://meeting.dxy.cn/bdgene/article/i19142.html

niwanmao

weide12 发表于 2015-11-13 12:03
PE应该是在561强，http://meeting.dxy.cn/bdgene/article/i19142.html

PE在496、 546、 565 nm均可以得到有效激发，至于比较哪个波长激发效率高，我认为跟抗体关系也挺大。另外，关键是561nm的激光少见啊，488nm才是标配啊。