关于流式对照阴性部分的界定

mingxu95

倪老师及各位站友：
有个小问题想请教一下，我做流式的时候设定了isotype对照，但是问题来了，阴性部分到底应该低于多少呢？还是根据等高线图直接在边缘设门？关于这个问题有没有一个约定俗成的规矩呢？
还有，像这类的小问题在哪可以找到比较全的资料参考呢？

谢谢各位

niwanmao

其实以前都讨论过很多次的：
http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-4533-1-1.html
http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-4545-1-1.html

小憨

看了倪老师推荐的帖子受益匪浅，也有些小经验能抛砖引玉，跟大家分享一下~ 我觉得设门就跟做统计检验一样，看你把检验水准设到多少了，可以是5%，也可以是1%，也可以是0.1%，但一般不会超过5%。流式的设门其实就是设定置信区间，一般我们都以95%作为置信区间的标准，对应在流式图上，落在峰两侧95%的细胞是来自同一个群体；而两侧各2.5%的细胞是来自另一个群体，是不正常的。你也可以把置信区间的范围画更大，比如99%置信区间；当然，我们在做阴性对照的时候根本不加抗体，人为保证了这些细胞肯定是没有结合抗体的，所以置信区间也可以是100%；做iso对照时，可能会有少部分非特异结合，所以可以把置信区间缩小一点，个人觉得95%是可以接受的。

mingxu95

niwanmao 发表于 2015-12-15 20:20
其实以前都讨论过很多次的：
http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-4533-1-1.html
http://www.flowcyto.cn/bb ...

感谢倪老师提供的重要信息，受益匪浅

mingxu95

小憨 发表于 2015-12-16 08:24
看了倪老师推荐的帖子受益匪浅，也有些小经验能抛砖引玉，跟大家分享一下~ 我觉得设门就跟做统计检验一样， ...

这见解倒是很独到，不过确实很有道理，点赞