Gallios结果在试用版Flowjo软件中显示不正常

INTORNS

    最近实验室在用Gallios仪器检测小鼠LSK细胞的增殖。    使用了FL1、FL2、FL4、FL5和FL6。其中FL4使用了线性模式获取的数据，其他通道为log模式。补偿均在仪器上做好了。
    放在申请30天试用版的Flowjo软件上进行分析，FSC和SSC散点图显示正常。但是FL1等荧光通道，其散点图或者直方图都无法正常显示，几乎没有细胞显示出来。即使调整了坐标范围以及双指数转换也不行。
    不知道各位有没有碰到这种情况。难道是Gallios数据和Flowjo软件不兼容？还是因为使用了一个线性模式通道以及补偿导致的？恳请各位知道的给解答一下，以及是否有解决办法。
    十分感谢！

didi_zhou

你应该是用的Kaluza for Gallios收集的结果，这个结果是最新的FCS 3.1格式，可能Flowjo不兼容。
你可以下载Kaluza试试看，一样有30天试用版。
我上传了两个图，第一个这个是你当时收集时候的效果，可能颜色有点乱，应为我后面重新分析了一下，门有点重叠。
第二张图是我帮你分析的结果（阴阳结合来圈Lin-的会更准），你可以参考参考：

niwanmao

有原始数据文件吗？传上来看看。

INTORNS

niwanmao 发表于 2016-3-18 20:04
有原始数据文件吗？传上来看看。

我编辑原来帖子的时候，因为原始数据太大（一个压缩后也有50 M），无法上传，所以我上传到了百度云盘，链接为http://pan.baidu.com/s/1bnOC4NX。
所用抗体为：Lineage-FITC；Sca-1-PE，c-kit-APC；Ki-67-PE-Cy7；以及7-AAD。
倪老师如果有时间，恳请帮忙看一下。

INTORNS

didi_zhou 发表于 2016-3-18 13:52
你应该是用的Kaluza for Gallios收集的结果，这个结果是最新的FCS 3.1格式，可能Flowjo不兼容。
你可以下载 ...

非常感谢，看来确实是软件兼容性的问题了。我们也要去购买Kaluza软件，至少都是Beckman的产品，兼容性应该没问题的。
另外，想进一步请教一下。流式结果里面的格式中，现在不都是3.0版本的吗？对流式结果的版本方面的内容不太了解。我们用的Gallios自带的软件做的结果在Flowjo不能支持，那我们的结果在学术上不是会存在风险？

didi_zhou

INTORNS 发表于 2016-3-20 10:47
非常感谢，看来确实是软件兼容性的问题了。我们也要去购买Kaluza软件，至少都是Beckman的产品，兼容性应 ...

格式是标准格式，格式升级了就包含更多信息。软件没升级到支持新的格式是软件的问题。Flowjo是个软件，不是权威，不要本末倒置了。不存在学术风险。

INTORNS

didi_zhou 发表于 2016-3-20 11:14
格式是标准格式，格式升级了就包含更多信息。软件没升级到支持新的格式是软件的问题。Flowjo是个软件，不 ...

好的。我明白了。
谢啦！