分析平均荧光强度该用Mean fluorescence intensity还是median fluores...

实验猿

在看文献的时候发现有的用Mean fluorescence intensity表示平均荧光强度，有的用median fluorescence intensity，到底该用哪个？请各位指教！

niwanmao

一般Mean可能指的是Geomean（几何平均数）。这是最常用的。如果荧光分布呈正态分布，Geomean和median等同。
详解请看这里：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-3483-1-1.html

实验猿

我分析的是细菌上的荧光强度，您觉得我用哪个较好呢？

实验猿

http://blog.sciencenet.cn/blog-349948-832667.html，倪老师，你觉得这个解释正确吗？

实验猿

niwanmao 发表于 2016-7-4 21:11
一般Mean可能指的是Geomean（几何平均数）。这是最常用的。如果荧光分布呈正态分布，Geomean和median等同。 ...

http://blog.sciencenet.cn/blog-349948-832667.html，倪老师，你觉得这个解释正确吗？

niwanmao

实验猿 发表于 2016-7-4 21:23
http://blog.sciencenet.cn/blog-349948-832667.html，倪老师，你觉得这个解释正确吗？ ...

站内不是写过类似的帖子吗：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2189-1-1.html
MFI一般就是指Geomean，除非特殊说明是Median

实验猿

niwanmao 发表于 2016-7-4 21:35
站内不是写过类似的帖子吗：http://www.flowcyto.cn/bbs/thread-2189-1-1.html
MFI一般就是指Geomean，除 ...

谢谢老师的解答，我测的是log数据，那就用median了

niwanmao

实验猿 发表于 2016-7-4 21:44
谢谢老师的解答，我测的是log数据，那就用median了

如果峰不呈正态分布，建议还是用Geomean

实验猿

niwanmao 发表于 2016-7-5 13:00
如果峰不呈正态分布，建议还是用Geomean

那处理数据作图时，是标mean fluoresence intensity还是Geomean fluoresesence intensity？我看文献上通常标的是mean fluoresence intensity或median fluoresence intensity

niwanmao

实验猿 发表于 2016-7-5 16:58
那处理数据作图时，是标mean fluoresence intensity还是Geomean fluoresesence intensity？我看文献上通 ...

一般用简称MFI，第一次提的时候用全称mean fluoresence intensity。median很少看到。