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[结构和原理] IC50计算公式,求个参数意义

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发表于 2016-11-28 17:18:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
悬赏5流星未解决
各位好:
      我们在计算IC50时一般会用软件自动拟合,研究后发现会有多种不同的拟合方法,其中一个四参数法进行拟合,公式如下:Y = Bottom + (Top – Bottom)/(1 + 10^((Log EC50 – X)*HillSlope));当我们不同数据输入后其各项值都是可以改变的,如bottom、top、Hillslope等,一些软件允许对其进行限制及修改,那么现在问题来了,这些参数是什么意义?我们修改的依据是什么?修改到怎样才更加合适?如何做才是合理的修改?
      再次感谢数学界、生物学界、药学界的各位大神!

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发表于 2016-11-28 22:07:14 | 显示全部楼层
统计方面的事情,肯定需要找统计软件的帮助内容:

Model
Y=Bottom + (Top-Bottom)/(1+10^((LogIC50-X)*HillSlope))


                               
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Interpret the parameters
IC50 is the concentration of agonist that gives a response half way between Bottom and Top. This is not the same as the response at Y=50. Depending on which units Y is expressed in, and the values of Bottom and Top, the IC50 may give a response nowhere near "50". Prism reports both the IC50 and its log.
HillSlope describes the steepness of the family of curves. A HillSlope of -1.0 is standard, and you should consider constraining the Hill Slope to a constant value of -1.0. A Hill slope more negative than -1 (say -2) is steeper.
Top and Bottom are plateaus in the units of the Y axis.

来源:http://www.graphpad.com/guides/p ... nhibit_variable.htm

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 楼主| 发表于 2016-11-29 12:42:02 | 显示全部楼层
多谢老师的细心解答,大体上明白那个希尔系数来反映陡峭程度,Bottom和Top是曲线的最高及最低平台期的值,只是还有个以为,当我们去限定这些参数时的依据是什么或者限定在什么范围内是合适的或者最好的?因为有些统计软件是允许我们去对这些值进行修改并加以限制的!多谢!
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发表于 2016-11-29 18:11:06 | 显示全部楼层
征服 发表于 2016-11-29 12:42
多谢老师的细心解答,大体上明白那个希尔系数来反映陡峭程度,Bottom和Top是曲线的最高及最低平台期的值, ...

我怎么印象中以前做研究生时计算IC50没这么复杂。
从图上看,Top和Bottom应该是做出来的吧,是高平台和低平台的值。
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 楼主| 发表于 2016-11-30 10:39:28 | 显示全部楼层
niwanmao 发表于 2016-11-29 18:11
我怎么印象中以前做研究生时计算IC50没这么复杂。
从图上看,Top和Bottom应该是做出来的吧,是高平台和低 ...

应该都是用软件直接拟合的,只是现在想知道,bottom及Top是如何依据原始数据得来的,想学习的稍微深一点....
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发表于 2016-11-30 20:05:46 | 显示全部楼层
征服 发表于 2016-11-30 10:39
应该都是用软件直接拟合的,只是现在想知道,bottom及Top是如何依据原始数据得来的,想学习的稍微深一点. ...

数学方面我是弱项
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 楼主| 发表于 2016-12-2 23:24:57 | 显示全部楼层
老师您谦虚了,非常感谢老师您,我会继续摸索着去学习,弄明白之后会在这里分享,多谢!
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 楼主| 发表于 2016-12-2 23:27:06 | 显示全部楼层
额额,这悬赏怎么给?以为天天关注就是老手了,结果还是生手
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发表于 2016-12-3 20:04:43 | 显示全部楼层
征服 发表于 2016-12-2 23:27
额额,这悬赏怎么给?以为天天关注就是老手了,结果还是生手

这个问题没有完全解决,留给以后解决问题的朋友吧
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